128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1854 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  99.6 
 
 
252 aa  520  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  99.6 
 
 
252 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  99.6 
 
 
252 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  99.6 
 
 
252 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  78.97 
 
 
252 aa  431  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  79.76 
 
 
252 aa  431  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  78.57 
 
 
249 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  76.59 
 
 
249 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  76.98 
 
 
249 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  76.98 
 
 
249 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  76.19 
 
 
249 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  76.19 
 
 
249 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  72.22 
 
 
252 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  59.92 
 
 
253 aa  321  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  59.92 
 
 
253 aa  321  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  59.52 
 
 
253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  57.71 
 
 
257 aa  301  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  43.44 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  38.43 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  38.43 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  38.02 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  38.02 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  37.6 
 
 
234 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  37.6 
 
 
234 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  37.6 
 
 
234 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  36.55 
 
 
234 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  38.24 
 
 
235 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  38.24 
 
 
234 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  36.93 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  34.8 
 
 
249 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  33.76 
 
 
246 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  35 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  35.89 
 
 
251 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  37.87 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  31.62 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  31.67 
 
 
249 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  30.71 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  31.69 
 
 
247 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  29.58 
 
 
289 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  29.28 
 
 
288 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  32.74 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.17 
 
 
288 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  25.93 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  29.75 
 
 
307 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  38.76 
 
 
311 aa  86.3  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  28.73 
 
 
288 aa  85.1  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.6 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  29.96 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  25.68 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.33 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  30.86 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  33.54 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.37 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  31.56 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2010  YdjC-like protein  32.84 
 
 
242 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  33.77 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  28.47 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  27.53 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.46 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  29 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  28.62 
 
 
294 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  28.62 
 
 
294 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.62 
 
 
294 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  29.74 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.81 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  30.32 
 
 
295 aa  72  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.49 
 
 
294 aa  72  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  26.09 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.35 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  26.77 
 
 
435 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1624  YdjC-like protein  31.8 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.35 
 
 
280 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.52 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  29.63 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.34 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1647  YdjC family protein  31.97 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  29.03 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  29.03 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  29.03 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  29.03 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  25.1 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  29.03 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  29.03 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2187  YdjC family protein  30.21 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.63 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.96 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  25.69 
 
 
291 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.69 
 
 
291 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  25.65 
 
 
275 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  25.83 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  26.72 
 
 
291 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.25 
 
 
291 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.63 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  26.1 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  30.32 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  28.92 
 
 
412 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  24.31 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  26.52 
 
 
297 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0125  hypothetical protein  30.67 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>