87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4311 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4311  YdjC family protein  100 
 
 		 349 aa  724    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.279208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3997  YdjC family protein  48.86 
 
 		 331 aa  338  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  49.29 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  30.26 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0422  YdjC family protein  31.46 
 
 		 295 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  0.0884188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  40.8 
 
 		 307 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2373  YdjC family protein  28.04 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1066  YdjC family protein  29.78 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  28.87 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  22.48 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  31.41 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  26.32 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  29.11 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  31.55 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  29.11 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  27.92 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  32.31 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  29.11 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  29.11 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  29.11 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  30.37 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  28.48 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  32.82 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.2 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.48 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.3 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  30.77 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.48 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.01 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  30.38 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.1 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  29.49 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  32.1 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  29.85 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  25.85 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  28.66 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  21.17 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  31.16 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  31.82 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  30.36 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  29.75 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1607  YdjC family protein  29.06 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  27.5 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.75 
 
 		 278 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.43 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  26.92 
 
 		 289 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  26.71 
 
 		 294 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25 
 
 		 294 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.38 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  24.38 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  24.38 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.77 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  23.12 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  29.11 
 
 		 275 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  25.77 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  23.12 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  23.12 
 
 		 289 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  23.12 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  23.12 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  23.12 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.63 
 
 		 288 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  28.06 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  29.01 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  29.01 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  29.01 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  22.5 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  29.01 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  29.01 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  29.01 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  24.49 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  29.01 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.85 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  28.03 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  27.04 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  21.98 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  28.4 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.57 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  27.04 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  25.93 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  27.04 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  27.27 
 
 		 252 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  26.72 
 
 		 252 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  21.9 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  26.09 
 
 		 257 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  25.48 
 
 		 254 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>