118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1054 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  100 
 
 		 294 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  97.96 
 
 		 294 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  93.2 
 
 		 294 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  93.2 
 
 		 294 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  93.2 
 
 		 294 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  93.54 
 
 		 294 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  87.07 
 
 		 294 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  80.97 
 
 		 295 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  80.97 
 
 		 295 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  80.97 
 
 		 295 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  80.97 
 
 		 295 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  81.31 
 
 		 289 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  80.62 
 
 		 295 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  80.97 
 
 		 295 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  71.54 
 
 		 280 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  70.79 
 
 		 274 aa  348  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  66.92 
 
 		 265 aa  348  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  67.5 
 
 		 283 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  66.04 
 
 		 275 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4902  hypothetical protein  72.58 
 
 		 251 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515239  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20670  hypothetical protein  62.34 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  52.63 
 
 		 291 aa  242  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  52.63 
 
 		 291 aa  242  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  46.79 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  47.14 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  50.53 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  47.89 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  48.46 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  48.3 
 
 		 267 aa  203  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  46.43 
 
 		 280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  45.42 
 
 		 280 aa  198  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  41.26 
 
 		 288 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  39.42 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  38.35 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  36.97 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  37.32 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  37.89 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  36.86 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  36.73 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  36.5 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  29.49 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  28.52 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  31.01 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  30.34 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  29.03 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  30.04 
 
 		 251 aa  93.2  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  28.78 
 
 		 245 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  27.63 
 
 		 247 aa  89.4  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  34.69 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  29.29 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  30.11 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  28.57 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  29.37 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  29.37 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  28.1 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  29.45 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  29.37 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  29.77 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  28.1 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  28.1 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  29 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  29.37 
 
 		 252 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  30.46 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  33.08 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  32.67 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  33.08 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  33.08 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  30.46 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  33.08 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  30.67 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  33.08 
 
 		 234 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  31.47 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  24.12 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  29.8 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0597  hypothetical protein  31.8 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  24.06 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  23.36 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  26.74 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  26.74 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  26.57 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  26.57 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  27.31 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  26.47 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  26.57 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  26.47 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  26.69 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  22.3 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  25.54 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  27.23 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  27.03 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  28.4 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  27.13 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  29.27 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  28.93 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1624  YdjC-like protein  30 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  31.71 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  25 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2236  YdjC family protein  30.22 
 
 		 224 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  33.08 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  29.53 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>