126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4972 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  100 
 
 
278 aa  563  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  43.48 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  41.67 
 
 
288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  42.39 
 
 
288 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  41.01 
 
 
289 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  42.03 
 
 
288 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  41.33 
 
 
288 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  40.29 
 
 
288 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  41.03 
 
 
280 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  39.56 
 
 
288 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  39.42 
 
 
294 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  39.85 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  39.85 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  39.85 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  39.47 
 
 
294 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  39.92 
 
 
275 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  39.47 
 
 
294 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  40.15 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  39.33 
 
 
295 aa  161  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  39.85 
 
 
291 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  39.85 
 
 
291 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  39.77 
 
 
295 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  39.77 
 
 
295 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  39.77 
 
 
295 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  39.77 
 
 
289 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  39.77 
 
 
295 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  39.77 
 
 
295 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.69 
 
 
280 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  36.69 
 
 
265 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20670  hypothetical protein  39.74 
 
 
235 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.11 
 
 
280 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.53 
 
 
280 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  37.46 
 
 
291 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  36.17 
 
 
284 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.79 
 
 
279 aa  148  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  36.88 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  37.61 
 
 
267 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  37.15 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  36.84 
 
 
283 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4902  hypothetical protein  39.04 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  31.58 
 
 
245 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  31.92 
 
 
435 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  30.99 
 
 
293 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  27.35 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  40.76 
 
 
235 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  30.1 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  37.25 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  36.71 
 
 
234 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  36.71 
 
 
234 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  29.53 
 
 
294 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  36.08 
 
 
234 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  36.08 
 
 
234 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  36.08 
 
 
234 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  36.08 
 
 
234 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  36.08 
 
 
234 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  35.44 
 
 
234 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  31.14 
 
 
253 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  35.4 
 
 
235 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  36.08 
 
 
234 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  31.14 
 
 
253 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  31.14 
 
 
253 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  34.59 
 
 
261 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  37.33 
 
 
254 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  34.59 
 
 
251 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  35.93 
 
 
247 aa  99  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  26.69 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  37.91 
 
 
252 aa  96.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  31.19 
 
 
412 aa  85.5  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  27.84 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  29.19 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  29.19 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  29.19 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  29.19 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  29.19 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  29.03 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  29.68 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  32.7 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  32.7 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  32.72 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  31.65 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  31.01 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  33.54 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  31.06 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  28.76 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0163  hypothetical protein  28.32 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1624  YdjC-like protein  26.92 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  28.99 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  32.59 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3769  hypothetical protein  27.16 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.937904  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  28.57 
 
 
283 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2585  YdjC-like protein  30.32 
 
 
244 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3997  YdjC family protein  25.93 
 
 
331 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1930  hypothetical protein  33.54 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  32.65 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>