83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1930 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1930  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3638  YdjC family protein  35.14 
 
 		 304 aa  138  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.962606  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  37.97 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  37.83 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1647  YdjC family protein  32.83 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  34.94 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  34.73 
 
 		 291 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  34.22 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2351  YdjC family protein  36.02 
 
 		 282 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  31.06 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4720  YdjC-like protein  34.35 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  33.85 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  33.84 
 
 		 291 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0695  hypothetical protein  30.2 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0263511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1482  hypothetical protein  30.2 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.929836  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  34.08 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  30.74 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  28.74 
 
 		 288 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2400  hypothetical protein  26.91 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2544  hypothetical protein  25.42 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2756  hypothetical protein  27.24 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1375  hypothetical protein  29.72 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000101211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0597  hypothetical protein  29.39 
 
 		 278 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5574  YdjC family protein  29.73 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120442  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0136  hypothetical protein  30.52 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0678064  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0125  hypothetical protein  30.12 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  28.78 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  27.38 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0768  hypothetical protein  25.56 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  35.25 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  30.6 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  32.14 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  25.1 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  25.1 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  25.1 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.54 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  28.37 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  26.34 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  26.34 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  23.89 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  26 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  27.16 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  23.89 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  24.7 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  29.63 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  30.14 
 
 		 288 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  23.89 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  23.89 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  23.89 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  24.55 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  33.56 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  25.1 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  24.29 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  25.93 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  25 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  24.6 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  24.29 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  30.52 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  30.52 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  25.69 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  27.97 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  29.87 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  28.57 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  28.57 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  28.57 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  29.87 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  24.19 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  27.03 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  27.03 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.03 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.03 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  29.67 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  27.03 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  30.56 
 
 		 412 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  30.28 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  27.03 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  25.29 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  30.28 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>