69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0136 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0136  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  497  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0678064  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0125  hypothetical protein  99.6 
 
 		 249 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  34.54 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  33.62 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  33.62 
 
 		 301 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2400  hypothetical protein  29.87 
 
 		 270 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  34.15 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1930  hypothetical protein  32.17 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2544  hypothetical protein  29.13 
 
 		 276 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  31.54 
 
 		 280 aa  85.1  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  34.91 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  35.19 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2756  hypothetical protein  30.58 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  31.93 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  33.48 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1647  YdjC family protein  30.47 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  38.46 
 
 		 311 aa  78.6  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4720  YdjC-like protein  33.88 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  33.86 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2351  YdjC family protein  28.96 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0768  hypothetical protein  32.66 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3638  YdjC family protein  34.18 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.962606  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1375  hypothetical protein  29.32 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000101211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  32 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  29.41 
 
 		 412 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0597  hypothetical protein  32.33 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5574  YdjC family protein  30.87 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120442  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  32.86 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  32.86 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  32.86 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  30.67 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  32.67 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0695  hypothetical protein  26.36 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0263511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1482  hypothetical protein  25.94 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.929836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  32.14 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  32.14 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  32.14 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  32.14 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  32.14 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  32.14 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  31.43 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  31.88 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  32.62 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  32.62 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  32.62 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  28.1 
 
 		 293 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.87 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0163  hypothetical protein  30.29 
 
 		 395 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  30.34 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  30.07 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  26.83 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  28.86 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  25.74 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.45 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.09 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  29.73 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  26.15 
 
 		 435 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  29.8 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  29.87 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  26.62 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  25.97 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  29.79 
 
 		 261 aa  42  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  26.91 
 
 		 288 aa  42  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>