67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2400 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2400  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  561  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2544  hypothetical protein  92.86 
 
 
276 aa  514  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0695  hypothetical protein  44.15 
 
 
273 aa  214  9e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0263511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1482  hypothetical protein  43.77 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.929836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  33.7 
 
 
288 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2756  hypothetical protein  35.77 
 
 
291 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0597  hypothetical protein  30.22 
 
 
278 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  33.46 
 
 
266 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  30.32 
 
 
292 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0768  hypothetical protein  28.98 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  30.11 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3638  YdjC family protein  30.08 
 
 
304 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.962606  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1647  YdjC family protein  29.78 
 
 
287 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  32.61 
 
 
311 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  28.92 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1375  hypothetical protein  28.68 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000101211  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  28.32 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5574  YdjC family protein  28.06 
 
 
293 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120442  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  28.32 
 
 
280 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  28.03 
 
 
297 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  28.47 
 
 
291 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  27.11 
 
 
280 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4720  YdjC-like protein  27.92 
 
 
296 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1930  hypothetical protein  26.91 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2351  YdjC family protein  26.86 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154967  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0125  hypothetical protein  29.13 
 
 
249 aa  85.5  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0136  hypothetical protein  29.87 
 
 
249 aa  85.5  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0678064  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  30.82 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  30.82 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  23.18 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  30.82 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0163  hypothetical protein  31.88 
 
 
395 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  24.55 
 
 
412 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  31.34 
 
 
252 aa  58.9  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  31.25 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  31.25 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  31.25 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  31.25 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  25.58 
 
 
435 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  30.56 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  30.37 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  31.3 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  31.3 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  30.37 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  30.37 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  31.3 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  31.3 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  28.1 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  23.33 
 
 
283 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  29.63 
 
 
252 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  23.45 
 
 
307 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  23.6 
 
 
247 aa  52.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  26.51 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  26.14 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  22.49 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  24.29 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  25.29 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  26.21 
 
 
288 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  28.03 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  31.06 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  25.66 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  28 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  25.16 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.34 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.03 
 
 
280 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.66 
 
 
280 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>