86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1678 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  567  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  66.79 
 
 		 280 aa  364  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  65.45 
 
 		 291 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  64.52 
 
 		 301 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  62.5 
 
 		 291 aa  344  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4720  YdjC-like protein  64.16 
 
 		 296 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  62.14 
 
 		 297 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2351  YdjC family protein  45.99 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  42.86 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  42.14 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  37.46 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1647  YdjC family protein  36.5 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3638  YdjC family protein  39.19 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.962606  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0695  hypothetical protein  31.9 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0263511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1482  hypothetical protein  31.54 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.929836  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1930  hypothetical protein  34.22 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  31.27 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0597  hypothetical protein  35.87 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2544  hypothetical protein  27.9 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2400  hypothetical protein  27.11 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1375  hypothetical protein  30.47 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000101211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5574  YdjC family protein  30.71 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  30.07 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2756  hypothetical protein  28.99 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0768  hypothetical protein  30.24 
 
 		 287 aa  92  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0125  hypothetical protein  34.81 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0136  hypothetical protein  34.81 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0678064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  26.98 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  26.98 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  27.17 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  27.14 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  36.5 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  27.17 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  27.17 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  26.86 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  27.6 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  28.69 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  26.45 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  26.45 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  25.32 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  25.49 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  26.92 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  26.24 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  24.31 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  24.31 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  28.64 
 
 		 412 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  26.36 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  25.2 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  25.2 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.19 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  29.34 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.93 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  34.93 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  29.34 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.22 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  28.22 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  28.22 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  25.64 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  28.37 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  24.64 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  29.86 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0163  hypothetical protein  29.65 
 
 		 395 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  28.21 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  25.91 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  30.67 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.52 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  25.91 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  28.78 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  24.15 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  27.33 
 
 		 435 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  27.15 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  28.29 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  32.47 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  25.18 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  25.9 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  25.9 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  38.55 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  30.07 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  25.9 
 
 		 234 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  25.9 
 
 		 234 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  25.53 
 
 		 234 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2585  YdjC-like protein  32.74 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  25.9 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  25.9 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  26.62 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>