95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3190 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  100 
 
 		 280 aa  567  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  80.41 
 
 		 291 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  69.64 
 
 		 301 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  68.68 
 
 		 291 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  66.79 
 
 		 280 aa  364  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4720  YdjC-like protein  67.5 
 
 		 296 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  68.86 
 
 		 297 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2351  YdjC family protein  47.81 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  39.78 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3638  YdjC family protein  40.44 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.962606  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  40.23 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1647  YdjC family protein  36 
 
 		 287 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  38.57 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0695  hypothetical protein  34.05 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0263511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1482  hypothetical protein  33.69 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.929836  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  32.61 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2756  hypothetical protein  30.69 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2400  hypothetical protein  28.32 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2544  hypothetical protein  29.17 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1930  hypothetical protein  34.08 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0597  hypothetical protein  31.99 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  30.74 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0768  hypothetical protein  30.38 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1375  hypothetical protein  29.45 
 
 		 272 aa  95.5  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000101211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5574  YdjC family protein  30.43 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120442  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  29.1 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  29.1 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0125  hypothetical protein  33.48 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0136  hypothetical protein  33.48 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0678064  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  27.46 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  27.46 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  27.46 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  27.46 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  27.46 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  27.46 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  26.25 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  26.45 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  26.53 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  26.45 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  26.45 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  25.83 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  25.83 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  25.83 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  32.68 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  27.74 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  26.67 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  26.43 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  26.51 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  29.64 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  27.34 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  24 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  23.32 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  24.65 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.08 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  27.48 
 
 		 412 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  30.08 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  30.08 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.68 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  30.08 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.53 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  31.62 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.4 
 
 		 279 aa  52.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  29.92 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  23.17 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  25.72 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.97 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  28.28 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0163  hypothetical protein  30.29 
 
 		 395 aa  49.3  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  24.73 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  30.07 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  23.95 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  23.66 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  25.97 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  23.66 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.61 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  25.78 
 
 		 288 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  27.31 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3769  hypothetical protein  22.93 
 
 		 267 aa  45.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.937904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  23.65 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  23.57 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  40.96 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  23.4 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  28.86 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.79 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  23.57 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  30.32 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  23.57 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  27.89 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  25.94 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  26.26 
 
 		 435 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2585  YdjC-like protein  32.54 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  25 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  23.75 
 
 		 235 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  21.75 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  22.9 
 
 		 234 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>