73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2756 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2756  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  599  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1375  hypothetical protein  36.26 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000101211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  37.02 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2544  hypothetical protein  37.31 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5574  YdjC family protein  37.27 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120442  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0597  hypothetical protein  37.5 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2400  hypothetical protein  35.77 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  37.02 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0695  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0263511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.929836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0768  hypothetical protein  33.1 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  37.68 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  34.83 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  36.94 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3638  YdjC family protein  34.15 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.962606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  30.69 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1647  YdjC family protein  28.88 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2351  YdjC family protein  29.96 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  28.87 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  28.62 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  29.53 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  28.99 
 
 		 280 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4720  YdjC-like protein  30.98 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  26.62 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1930  hypothetical protein  27.24 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0125  hypothetical protein  30.93 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0136  hypothetical protein  30.51 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0678064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  29.38 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  28.89 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  28.26 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  28.26 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  28.26 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  25.82 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  26.76 
 
 		 253 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0163  hypothetical protein  25.72 
 
 		 395 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  27.92 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  29.2 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  28.68 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  28.15 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  27.56 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  23.1 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3769  hypothetical protein  23.63 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.937904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.49 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  27.94 
 
 		 234 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  27.94 
 
 		 234 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  27.94 
 
 		 234 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  27.94 
 
 		 234 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  27.94 
 
 		 234 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  27.94 
 
 		 234 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  27.63 
 
 		 234 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  25.37 
 
 		 283 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.48 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  21.11 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  26.24 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  26.97 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  24.71 
 
 		 435 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  28.12 
 
 		 288 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  23.85 
 
 		 249 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  23.85 
 
 		 249 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.19 
 
 		 279 aa  45.8  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  25.56 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.35 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  23.46 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  23.85 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1624  YdjC-like protein  21.9 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  23.85 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  23.85 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  27.03 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  25.55 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  25.37 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  27.07 
 
 		 235 aa  42.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>