121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0263 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  100 
 
 
249 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  39.84 
 
 
245 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  36.51 
 
 
254 aa  168  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  42.17 
 
 
235 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  34.68 
 
 
247 aa  165  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  38.25 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  35.74 
 
 
252 aa  158  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  38.43 
 
 
253 aa  156  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  35.89 
 
 
251 aa  151  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  38.36 
 
 
234 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  36.36 
 
 
249 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  38.14 
 
 
235 aa  148  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  32.79 
 
 
251 aa  148  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  41.2 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  37.29 
 
 
234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  37.29 
 
 
234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  37.29 
 
 
234 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  36.86 
 
 
234 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  36.86 
 
 
234 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  36.86 
 
 
234 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  36.86 
 
 
234 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  36.86 
 
 
234 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  34.21 
 
 
293 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  33.46 
 
 
253 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  33.46 
 
 
253 aa  122  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  33.46 
 
 
253 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  32.55 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  29.08 
 
 
288 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  31.45 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.35 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  30.28 
 
 
249 aa  111  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  30.28 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  30.28 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  30.28 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  30.28 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  30.28 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  29.68 
 
 
288 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  29.88 
 
 
252 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  30.28 
 
 
252 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  29.21 
 
 
307 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.79 
 
 
288 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  27.05 
 
 
307 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  30.04 
 
 
252 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1624  YdjC-like protein  28.17 
 
 
224 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.36 
 
 
288 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  27.92 
 
 
288 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  27.69 
 
 
280 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0422  YdjC family protein  24.55 
 
 
295 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  0.0884188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  27.17 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  29.87 
 
 
294 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.59 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.47 
 
 
291 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  28.47 
 
 
291 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2373  YdjC family protein  23.44 
 
 
299 aa  96.3  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  25.18 
 
 
289 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.34 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.68 
 
 
280 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2236  YdjC family protein  27.38 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  29.44 
 
 
294 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  29.44 
 
 
294 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.44 
 
 
294 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1066  YdjC family protein  24.36 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2187  YdjC family protein  28.11 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  29.13 
 
 
294 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  28.85 
 
 
283 aa  89  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  23.02 
 
 
280 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2324  YdjC family protein  27.38 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  27.68 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  29.24 
 
 
295 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.62 
 
 
279 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  28.7 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  29.57 
 
 
295 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.26 
 
 
280 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  29.57 
 
 
295 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  29.57 
 
 
295 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  29.57 
 
 
295 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  26.2 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.44 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.86 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  26.84 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  35.14 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.68 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  23.51 
 
 
331 aa  79  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  22.02 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  26.41 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20670  hypothetical protein  24.76 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  26.95 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4311  YdjC family protein  22.48 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.279208  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  21.07 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3997  YdjC family protein  21.68 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.56 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  30.92 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  27.34 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  24.73 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  24.67 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>