88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4675 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  100 
 
 		 283 aa  588  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  32.37 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0422  YdjC family protein  27.37 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  0.0884188 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2373  YdjC family protein  25.58 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1066  YdjC family protein  27.37 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  26.82 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3997  YdjC family protein  31.82 
 
 		 331 aa  85.9  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  35.25 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  26.32 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4311  YdjC family protein  30.49 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.279208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  27.34 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  26.39 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  27.5 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  28.31 
 
 		 252 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  26.48 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  31.9 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  25.1 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  32.32 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  25.46 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.57 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  26.7 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  26.7 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  26.7 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  26.7 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.42 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  30.06 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.42 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  23.95 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.16 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.88 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  27.15 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  32.17 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  27.85 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  26.24 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  21.33 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  30.5 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  29.1 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  29.93 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  29.45 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  23.38 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.99 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  25.28 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.58 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.5 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  31.69 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  23.38 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  23.38 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  23.38 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  25 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  28.83 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  25 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  25 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.54 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.88 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  29.11 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  24.18 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  33.72 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  24.48 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  23.63 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  24.85 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  23.63 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  24.85 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  24.85 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  32.93 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  32.93 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  32.93 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.34 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  32.93 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  32.05 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  25.15 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  25.19 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1607  YdjC family protein  29.61 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.93 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  24.44 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  24.44 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  24.44 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2585  YdjC-like protein  35.48 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  24.44 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  25 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  24.44 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  31.71 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  31.71 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  24.03 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.56 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>