68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0422 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0422  YdjC family protein  100 
 
 		 295 aa  598  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  0.0884188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1066  YdjC family protein  82.99 
 
 		 295 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2373  YdjC family protein  50.51 
 
 		 299 aa  299  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3997  YdjC family protein  33.33 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  38.28 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  33.33 
 
 		 331 aa  178  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  32.3 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4311  YdjC family protein  31.46 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.279208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  27.37 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  24.55 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  26.35 
 
 		 253 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  28.26 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  25.82 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  25.93 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  24.4 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.03 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  26.2 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  25.91 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  26.13 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  26.1 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  26.02 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  25.18 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  25.88 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  25.65 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  25.65 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  25.65 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.52 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  24.28 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  27.74 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  22.88 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  22.87 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  20.07 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  22.62 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  28.91 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  26.99 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  28.95 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  28.25 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  25.37 
 
 		 252 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  28.98 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  28.98 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  26.53 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  28.41 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1607  YdjC family protein  32.28 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  24.28 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  24.28 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  24.28 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  24.28 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  24.28 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  28.95 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  24.1 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  24.31 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.07 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  30.46 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  31.85 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.13 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.28 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2585  YdjC-like protein  30.25 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.72 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  25.66 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  26.07 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.38 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  23.59 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.22 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2010  YdjC-like protein  34.82 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>