62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1066 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1066  YdjC family protein  100 
 
 		 295 aa  593  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0422  YdjC family protein  82.99 
 
 		 295 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  0.0884188 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2373  YdjC family protein  51.88 
 
 		 299 aa  298  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  35.12 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  38 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3997  YdjC family protein  33.45 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  29.05 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4311  YdjC family protein  29.78 
 
 		 349 aa  148  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.279208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  27.37 
 
 		 283 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  24.36 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  24.18 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  23.83 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  25.54 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  24.4 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.27 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  23.13 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  31.78 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  24.71 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  24.71 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  24.71 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  24.71 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  24.31 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  24.71 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  24.91 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  27.95 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  24.31 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  22.22 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  23.85 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  24.31 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  27.56 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  25.29 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  20.59 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  23.26 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  22.91 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  22.41 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  27.08 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  22.8 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  23.47 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  25.78 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.16 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  24.16 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  32.33 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  24.65 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  24.65 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  24.65 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.06 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  27.01 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  29.19 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  33.06 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  30.25 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  29.86 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  29.86 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.61 
 
 		 280 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  23.93 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  26.67 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  26.67 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1607  YdjC family protein  30.71 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.87 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  26.06 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2585  YdjC-like protein  29.41 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>