100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2484 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  100 
 
 		 311 aa  631  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  37.88 
 
 		 307 aa  228  9e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0422  YdjC family protein  38.28 
 
 		 295 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  0.0884188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3997  YdjC family protein  33.82 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  32.91 
 
 		 331 aa  175  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1066  YdjC family protein  38 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2373  YdjC family protein  33.77 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4311  YdjC family protein  30.54 
 
 		 349 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.279208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  26.82 
 
 		 283 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  26.2 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  29.08 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.44 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  27.01 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  28.62 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  32.03 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  34.06 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.33 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  26.94 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  24.63 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.05 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.93 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  26.14 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.71 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  26.17 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  28.05 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  31.61 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  31.06 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.99 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  24.26 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  26.87 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  31.68 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  33.59 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  31.06 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  31.06 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  26.16 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  27.85 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  31.06 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  31.06 
 
 		 234 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  31.06 
 
 		 234 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  27.13 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2585  YdjC-like protein  34.17 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.13 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.1 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  27.24 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  30.43 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  30.07 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.05 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  27.05 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  27.05 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  27.49 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  27.49 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  28.14 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  29.22 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.14 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  30.6 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  30.86 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  26.9 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  26.79 
 
 		 246 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.36 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.55 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.99 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  27.22 
 
 		 280 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1607  YdjC family protein  30.72 
 
 		 287 aa  53.5  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  28.66 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  28.66 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  28.66 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  28.66 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  28.66 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  28.66 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.26 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  32.52 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  25.77 
 
 		 252 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  26.67 
 
 		 252 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  30.22 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  43.24 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  26.06 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  28.41 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  24.68 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  27.27 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  26.95 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  27.27 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  27.27 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  27.27 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  27.27 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  26.95 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.12 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  23.72 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  30.37 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  26.9 
 
 		 257 aa  45.8  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  25.48 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  30.19 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.19 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  37.68 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  25.94 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  36.23 
 
 		 288 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>