25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1607 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1607  YdjC family protein  100 
 
 
287 aa  548  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  32.58 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3997  YdjC family protein  30.4 
 
 
331 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  24.37 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  25.17 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  25.63 
 
 
234 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  25.63 
 
 
234 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  25.63 
 
 
234 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  25.63 
 
 
234 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  24.79 
 
 
235 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  25.21 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4311  YdjC family protein  25.87 
 
 
349 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.279208  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  25.21 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  25.21 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  30.72 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  24.79 
 
 
234 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2373  YdjC family protein  29.18 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  24.88 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0422  YdjC family protein  32.28 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  0.0884188 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  29.03 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  25.5 
 
 
249 aa  49.7  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  26.88 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  23.85 
 
 
235 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  29.61 
 
 
283 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1066  YdjC family protein  30.71 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>