108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1624 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1624  YdjC-like protein  100 
 
 
224 aa  433  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2236  YdjC family protein  93.75 
 
 
224 aa  357  6e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2324  YdjC family protein  93.3 
 
 
224 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2187  YdjC family protein  74.54 
 
 
244 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  28.17 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  35.66 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  32 
 
 
254 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  30.77 
 
 
261 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  33.2 
 
 
253 aa  98.6  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  33.2 
 
 
253 aa  98.6  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  32.81 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  33.47 
 
 
252 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  31 
 
 
234 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  31 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  31.62 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  31.37 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  31 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  31.37 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  31.64 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  31.37 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  31.76 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  31.62 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  31 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  30.57 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  30.57 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  30.87 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  29.18 
 
 
235 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  30.13 
 
 
235 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  31.64 
 
 
252 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  32.4 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  32.4 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  26.83 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  31 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  29.69 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  32.4 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  32.4 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  32.4 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  26.29 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  30.98 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.38 
 
 
278 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  27.27 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  27.71 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  29.88 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  27.06 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  27.14 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  29.18 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  26.53 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  26.69 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  28.01 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.5 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4902  hypothetical protein  33.86 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  31.18 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  31.25 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  31.25 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  28.63 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.25 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  31.75 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30 
 
 
280 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  30.31 
 
 
280 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.11 
 
 
288 aa  62  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.47 
 
 
288 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  28.96 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.67 
 
 
283 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.91 
 
 
280 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  28.62 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  32.24 
 
 
292 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.96 
 
 
280 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  27.68 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  28.47 
 
 
288 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.28 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.09 
 
 
294 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.2 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  22.63 
 
 
307 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  32.02 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  32.02 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  32.02 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  32.02 
 
 
289 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20670  hypothetical protein  30.32 
 
 
235 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  26.26 
 
 
289 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  32.02 
 
 
295 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.85 
 
 
288 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0422  YdjC family protein  26.91 
 
 
295 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  0.0884188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  32.02 
 
 
295 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.09 
 
 
274 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  30.41 
 
 
288 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  31.37 
 
 
261 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  32.41 
 
 
295 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.07 
 
 
279 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2756  hypothetical protein  23.02 
 
 
291 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0768  hypothetical protein  28.08 
 
 
287 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  30.42 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5574  YdjC family protein  30.77 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  25.52 
 
 
291 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  29.93 
 
 
288 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  25.18 
 
 
297 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2351  YdjC family protein  31.72 
 
 
282 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154967  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1375  hypothetical protein  26.62 
 
 
272 aa  45.1  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000101211  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0597  hypothetical protein  28.36 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>