79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20670 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_20670  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  72.48 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  62.34 
 
 		 294 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  62.34 
 
 		 294 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  61.9 
 
 		 280 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  61.47 
 
 		 294 aa  268  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  60.61 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  60.61 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  60.61 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  62.34 
 
 		 295 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4902  hypothetical protein  67.1 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  61.04 
 
 		 289 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  61.04 
 
 		 295 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  61.04 
 
 		 295 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  61.04 
 
 		 295 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  61.04 
 
 		 295 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  64.79 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  60.61 
 
 		 295 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  58.45 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  55.41 
 
 		 283 aa  241  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  57.67 
 
 		 274 aa  235  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  52.81 
 
 		 291 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  52.81 
 
 		 291 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  46.28 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  48.76 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  50 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  48.35 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  47.35 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  49.57 
 
 		 279 aa  182  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  46.48 
 
 		 267 aa  180  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  47.11 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  40.24 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  39.74 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  39.08 
 
 		 288 aa  151  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  40.17 
 
 		 289 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  39.41 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  40.09 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  37.5 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  37.71 
 
 		 288 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  37.66 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  24.76 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  28 
 
 		 435 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  26.82 
 
 		 293 aa  72  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  25.42 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  27.23 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  28.17 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  24.79 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  26.56 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  28.27 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  28.27 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  24.62 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  28.27 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  26.52 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  30.77 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  29.06 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  30.43 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  24.08 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  25.52 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  25.13 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  24.87 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  22.53 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  24.48 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  24.48 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  27.97 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  23.96 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  23.96 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  24.48 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  27.5 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  23.38 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  29.34 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  25.96 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  25.96 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1624  YdjC-like protein  29.08 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  25.53 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  25.53 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  21.81 
 
 		 253 aa  42  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  25.53 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3769  hypothetical protein  24.29 
 
 		 267 aa  42  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.937904  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>