More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3796 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00099  translocase  72.3 
 
 		 901 aa  1363    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  72.3 
 
 		 901 aa  1363    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0434  preprotein translocase subunit SecA  43.78 
 
 		 952 aa  756    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  52.08 
 
 		 897 aa  927    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  63.12 
 
 		 911 aa  1177    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  47.57 
 
 		 922 aa  860    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  47.36 
 
 		 844 aa  825    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  64.08 
 
 		 842 aa  1128    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0549  preprotein translocase subunit SecA  48.42 
 
 		 868 aa  843    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  58.67 
 
 		 934 aa  1091    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  49.06 
 
 		 835 aa  849    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  68.98 
 
 		 893 aa  1309    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  49.67 
 
 		 862 aa  833    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1687  preprotein translocase subunit SecA  44.7 
 
 		 842 aa  737    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  53.52 
 
 		 906 aa  944    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  87.67 
 
 		 908 aa  1627    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4400  preprotein translocase, SecA subunit  61.66 
 
 		 913 aa  1139    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  48.73 
 
 		 835 aa  848    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  48.73 
 
 		 835 aa  848    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  48.73 
 
 		 835 aa  848    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  59.72 
 
 		 931 aa  1102    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  62.25 
 
 		 896 aa  1169    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  62.36 
 
 		 896 aa  1169    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  61.01 
 
 		 913 aa  1144    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0248  preprotein translocase subunit SecA  55.44 
 
 		 929 aa  1050    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  61.6 
 
 		 904 aa  1129    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 968 aa  811    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  57.63 
 
 		 924 aa  1078    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  48.36 
 
 		 862 aa  834    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  62.62 
 
 		 923 aa  1150    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0390  preprotein translocase subunit SecA  50.31 
 
 		 953 aa  899    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  59.72 
 
 		 931 aa  1102    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  66.85 
 
 		 903 aa  1266    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  62.24 
 
 		 934 aa  1156    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  51.91 
 
 		 908 aa  932    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 896 aa  959    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  60.3 
 
 		 932 aa  1114    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  53.9 
 
 		 899 aa  950    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  52.28 
 
 		 864 aa  907    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  58 
 
 		 910 aa  1069    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  48.73 
 
 		 835 aa  848    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  48.02 
 
 		 857 aa  816    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  60.86 
 
 		 917 aa  1156    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  54.36 
 
 		 896 aa  969    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  52.38 
 
 		 896 aa  924    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 930 aa  1102    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  50.52 
 
 		 962 aa  918    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  49 
 
 		 994 aa  763    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0530  preprotein translocase subunit SecA  51.3 
 
 		 946 aa  911    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  51.25 
 
 		 911 aa  901    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0232  preprotein translocase, SecA subunit  48.67 
 
 		 804 aa  758    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  49.01 
 
 		 862 aa  837    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0289  preprotein translocase subunit SecA  51.69 
 
 		 903 aa  902    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.703701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  58.14 
 
 		 921 aa  1059    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  63.02 
 
 		 917 aa  1181    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0526  preprotein translocase subunit SecA  50.73 
 
 		 947 aa  901    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723301  normal  0.383723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  64.23 
 
 		 908 aa  1175    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  58.05 
 
 		 921 aa  1072    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  59.89 
 
 		 936 aa  1097    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  88.09 
 
 		 907 aa  1661    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0299  preprotein translocase subunit SecA  50.42 
 
 		 946 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  61.79 
 
 		 912 aa  1143    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  50.93 
 
 		 951 aa  907    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0274  preprotein translocase subunit SecA  55.51 
 
 		 926 aa  1056    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  58.65 
 
 		 930 aa  1096    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  48.75 
 
 		 993 aa  891    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1058  preprotein translocase subunit SecA  47.85 
 
 		 869 aa  729    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.981267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2917  preprotein translocase subunit SecA  51.26 
 
 		 895 aa  909    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  51.03 
 
 		 911 aa  913    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  60.11 
 
 		 932 aa  1115    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1353  preprotein translocase subunit SecA  48.07 
 
 		 947 aa  752    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  49.09 
 
 		 902 aa  841    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  71.49 
 
 		 909 aa  1354    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  53.04 
 
 		 910 aa  937    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  51.05 
 
 		 840 aa  863    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  51.16 
 
 		 845 aa  866    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  65.01 
 
 		 898 aa  1228    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  88 
 
 		 908 aa  1630    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  88.11 
 
 		 908 aa  1632    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  63.9 
 
 		 909 aa  1194    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 906 aa  1866    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  50.17 
 
 		 830 aa  874    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  49.59 
 
 		 955 aa  917    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  60.41 
 
 		 931 aa  1111    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  63.83 
 
 		 916 aa  1196    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  45.56 
 
 		 865 aa  763    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1705  preprotein translocase subunit SecA  43.76 
 
 		 849 aa  746    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2706  preprotein translocase subunit SecA  46.59 
 
 		 912 aa  740    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0684143  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  60.21 
 
 		 932 aa  1117    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  52.13 
 
 		 840 aa  908    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  55.8 
 
 		 901 aa  1014    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  88.11 
 
 		 908 aa  1632    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  49.77 
 
 		 1009 aa  785    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  49.12 
 
 		 855 aa  828    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  53.47 
 
 		 896 aa  929    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2599  preprotein translocase subunit SecA  50.66 
 
 		 901 aa  884    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.213228  normal  0.874755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  45.78 
 
 		 937 aa  783    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  82.82 
 
 		 908 aa  1567    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1371  preprotein translocase subunit SecA  48.07 
 
 		 947 aa  752    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.719275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  67.77 
 
 		 906 aa  1273    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>