More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2567 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  100 
 
 		 318 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  85.29 
 
 		 308 aa  522  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  80.19 
 
 		 310 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  80.19 
 
 		 310 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  80.19 
 
 		 310 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  80.19 
 
 		 310 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  77.04 
 
 		 325 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  81.94 
 
 		 308 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  82.27 
 
 		 306 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  82.27 
 
 		 306 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  82.27 
 
 		 306 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  79.67 
 
 		 314 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  78.83 
 
 		 308 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  76.04 
 
 		 322 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  82.45 
 
 		 312 aa  481  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  76.16 
 
 		 322 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  68.81 
 
 		 305 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  66.56 
 
 		 309 aa  418  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  64.5 
 
 		 314 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  59.41 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  58.17 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  58.5 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  56.86 
 
 		 318 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  50 
 
 		 329 aa  258  7e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  45.86 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  43.3 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  40.89 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  41.64 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  31.15 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.04 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  28.27 
 
 		 246 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  30.58 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  26.3 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  28.47 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  28.11 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  23.81 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  26.76 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  24.4 
 
 		 275 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  27.99 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  28.32 
 
 		 241 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  33.22 
 
 		 275 aa  99.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  99  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  23.88 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  26.86 
 
 		 269 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  25.94 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  26.95 
 
 		 323 aa  96.3  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  25.09 
 
 		 263 aa  95.9  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  26.26 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  24.1 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  24.01 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  27.05 
 
 		 248 aa  94  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  35.5 
 
 		 256 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  37.7 
 
 		 266 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 259 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  27.4 
 
 		 265 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  25.81 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  31.29 
 
 		 236 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  25.18 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  35.37 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  32.73 
 
 		 227 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  23.49 
 
 		 271 aa  89.7  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  24.37 
 
 		 263 aa  89.7  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  32.53 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  24.37 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  24.83 
 
 		 245 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  32.53 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  31.93 
 
 		 225 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  21.53 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  25.9 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  25.77 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  23.99 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  31.93 
 
 		 225 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  31.93 
 
 		 225 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  31.93 
 
 		 225 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  31.93 
 
 		 225 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  31.93 
 
 		 225 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  31.93 
 
 		 225 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  25 
 
 		 280 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  34.1 
 
 		 252 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  24.92 
 
 		 279 aa  85.9  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1496  OmpA/MotB  29.75 
 
 		 276 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  34.06 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  27.54 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  31.33 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  24.13 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2221  OmpA/MotB domain protein  28.14 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2101  OmpA/MotB  27.59 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61631 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  24.13 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  30.95 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  25.5 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  48.05 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  28.02 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.33 
 
 		 442 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  26.58 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  33.11 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  25.62 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  23.84 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  33.33 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.79 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>