59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2175 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  748    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  86.19 
 
 		 359 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  36.02 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  38.24 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  36.63 
 
 		 341 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  33.64 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  31.01 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  32.96 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  32.83 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  33.91 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  34.32 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  34.07 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  32.02 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  28.51 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  30.56 
 
 		 310 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  30.59 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  32.75 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  32.56 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  33.64 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  31.32 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  32.99 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  30.72 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  30.81 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  32.76 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  43.62 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  32.56 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  31.58 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  29.73 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  31.02 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  27.62 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  27.62 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  30.91 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  29.79 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.67 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.713533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  25.88 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  28.32 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  27.6 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  29.08 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.34 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4509  extracellular metalloprotease  30.77 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000972631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  33.33 
 
 		 306 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  32.26 
 
 		 506 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3475  V8-like Glu-specific endopeptidase-like protein  24.71 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  26.04 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  25.97 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  28.95 
 
 		 299 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  31.52 
 
 		 407 aa  49.7  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  27.4 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.65 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  28.86 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  28.77 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  31.2 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0587  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.53 
 
 		 444 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  26.62 
 
 		 352 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  26.55 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  27.12 
 
 		 311 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0694  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.24 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  26.67 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2893  hypothetical protein  21.4 
 
 		 272 aa  43.5  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0812422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>