More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1587 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3269  putative multidrug resistance protein  37.67 
 
 		 1023 aa  678    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2782  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.64 
 
 		 1036 aa  870    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0804863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  40.24 
 
 		 1014 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2065  acriflavin resistance protein  39.8 
 
 		 1027 aa  708    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.824615  normal  0.45428 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  59.57 
 
 		 1030 aa  1198    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  40 
 
 		 1014 aa  706    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3802  acriflavin resistance protein  45 
 
 		 1058 aa  862    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578442  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001981  RND multidrug efflux transporter  40.18 
 
 		 1040 aa  724    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  36.94 
 
 		 1029 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  39.76 
 
 		 1040 aa  724    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  40.3 
 
 		 1036 aa  726    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0929  acriflavin resistance protein  40.8 
 
 		 1033 aa  733    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1045  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  40.63 
 
 		 1033 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8251  acriflavin resistance protein  40.28 
 
 		 1021 aa  719    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236714  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  40.32 
 
 		 1015 aa  724    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1497  RND HAE1/HME family protein  40.82 
 
 		 1036 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  40.51 
 
 		 1015 aa  727    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0382  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  40.63 
 
 		 1033 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  40.16 
 
 		 1019 aa  717    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5960  acriflavin resistance protein  41.24 
 
 		 1017 aa  707    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.618564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2283  acriflavin resistance protein  40.93 
 
 		 1031 aa  720    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0079  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  40.82 
 
 		 1036 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1611  acriflavin resistance protein  38.21 
 
 		 1028 aa  700    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.921522  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0201  acriflavin resistance protein  40.12 
 
 		 1028 aa  736    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0707  acriflavin resistance protein  39.39 
 
 		 1025 aa  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  39.44 
 
 		 1009 aa  719    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2244  AcrB/AcrD/AcrF cation/multidrug efflux pump  44.72 
 
 		 1030 aa  864    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  39.94 
 
 		 1014 aa  711    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3678  acriflavin resistance protein  39.9 
 
 		 1027 aa  695    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1581  RND HAE1/HME family protein  40.82 
 
 		 1036 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1024  acriflavin resistance protein  44.77 
 
 		 1037 aa  850    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1638  acriflavin resistance protein  45.11 
 
 		 1047 aa  861    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3699  acriflavin resistance protein  40.37 
 
 		 1029 aa  732    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.459748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1287  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  40.72 
 
 		 1036 aa  710    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2236  acriflavin resistance protein  45.01 
 
 		 1047 aa  861    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3649  acriflavin resistance protein  41.38 
 
 		 1035 aa  734    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1118  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.22 
 
 		 1043 aa  810    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0778165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1651  acriflavin resistance protein  41.6 
 
 		 1026 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3372  acriflavin resistance protein  39.07 
 
 		 1021 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00480  multidrug efflux pump  40.35 
 
 		 1040 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4150  acriflavin resistance protein  38.81 
 
 		 1027 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0528  acriflavin resistance protein  40.65 
 
 		 1026 aa  707    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0032  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  40.63 
 
 		 1033 aa  675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1587  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1019 aa  2044    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2411  acriflavin resistance protein  40.33 
 
 		 1013 aa  695    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.848579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  40.69 
 
 		 1034 aa  749    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3139  acriflavin resistance protein  39.43 
 
 		 1012 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389349  normal  0.483157 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  39.55 
 
 		 1028 aa  692    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2737  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  38.72 
 
 		 1026 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.917561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2699  acriflavin resistance protein  40.44 
 
 		 1029 aa  725    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  41 
 
 		 1032 aa  755    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  36.94 
 
 		 1029 aa  638    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0891  RND efflux transporter  40.24 
 
 		 1029 aa  732    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2951  acriflavin resistance protein  44.32 
 
 		 1038 aa  863    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  39.38 
 
 		 1026 aa  716    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7711  acriflavin resistance protein  39.78 
 
 		 1017 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  36.32 
 
 		 1024 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0089  putative integral membrane component of multidrug efflux system  39.53 
 
 		 1022 aa  706    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  40.18 
 
 		 1018 aa  706    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0857  acriflavin resistance protein  38.26 
 
 		 1033 aa  687    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1202  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  40.63 
 
 		 1033 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  39.94 
 
 		 1017 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  40.35 
 
 		 1019 aa  720    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  39.8 
 
 		 1026 aa  710    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  40.44 
 
 		 1014 aa  711    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09520  RND efflux transporter  40.34 
 
 		 1029 aa  730    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0465  acriflavin resistance protein  38.42 
 
 		 1025 aa  686    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.471269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  39.88 
 
 		 1018 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0768  acriflavin resistance protein  44.71 
 
 		 1032 aa  857    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0945  acriflavin resistance protein  37.02 
 
 		 1021 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0774817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0371  acriflavin resistance protein  39.12 
 
 		 1029 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0357  acriflavin resistance protein  38.98 
 
 		 1030 aa  694    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1711  acriflavin resistance protein  45.11 
 
 		 1047 aa  862    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  40.95 
 
 		 1034 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1988  acriflavin resistance protein  39.37 
 
 		 1011 aa  669    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0090  acriflavin resistance protein  37.89 
 
 		 1020 aa  625  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1155  acriflavin resistance protein  35.99 
 
 		 1025 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1496  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 		 1025 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2803  RND family multidrug/cation transporter  35.43 
 
 		 1025 aa  625  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1553  acriflavin resistance protein  39.18 
 
 		 1026 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000421809 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1878  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  39.18 
 
 		 1026 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 		 1024 aa  622  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  37.03 
 
 		 1023 aa  611  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  35.81 
 
 		 1022 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.18 
 
 		 1024 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0615  cation/multidrug efflux protein  37.6 
 
 		 1038 aa  592  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0111  acriflavin resistance protein  35.74 
 
 		 1028 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  35.24 
 
 		 1064 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  35.76 
 
 		 1025 aa  575  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1051 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  33.56 
 
 		 1012 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  33.56 
 
 		 1012 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 		 1029 aa  554  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  31.46 
 
 		 1057 aa  532  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  33.5 
 
 		 1068 aa  532  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  34.4 
 
 		 1040 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3904  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  32.85 
 
 		 1041 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.31694  normal  0.33594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1037 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1048 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 		 1037 aa  515  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>