39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0345 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  49.78 
 
 		 235 aa  225  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  48.88 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  47.75 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  49.25 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  40.25 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  41.52 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  39.82 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  45.13 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  41.35 
 
 		 221 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  39.53 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  40.38 
 
 		 221 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  40.38 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  39.37 
 
 		 234 aa  148  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  36.6 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  36.7 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  36.28 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  35.51 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  34.55 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  33.05 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  32.14 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  32.05 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  28.9 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.49 
 
 		 658 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  31.98 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  32.27 
 
 		 639 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  30.43 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  27.8 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.77 
 
 		 260 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  27.36 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.71 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.14 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.43 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  24.23 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  26.8 
 
 		 482 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  25 
 
 		 378 aa  45.4  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  21.47 
 
 		 501 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>