129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_4005 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  100 
 
 		 498 aa  1043    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  44.95 
 
 		 502 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  44.73 
 
 		 517 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  43.45 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  42.12 
 
 		 499 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  42.15 
 
 		 501 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  42.15 
 
 		 501 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  41.45 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  35.74 
 
 		 529 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  35.74 
 
 		 529 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  36.77 
 
 		 515 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  34.71 
 
 		 513 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  34.71 
 
 		 513 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  34.8 
 
 		 538 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  34.49 
 
 		 513 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.59 
 
 		 538 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  34.17 
 
 		 538 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  33.74 
 
 		 514 aa  273  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  34.17 
 
 		 538 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  34.17 
 
 		 538 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  34.17 
 
 		 538 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  37.74 
 
 		 501 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  36.7 
 
 		 506 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  37.5 
 
 		 501 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.59 
 
 		 537 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  36.74 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  33.26 
 
 		 526 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  39.47 
 
 		 507 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  35.12 
 
 		 524 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  34.9 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  38.89 
 
 		 505 aa  259  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  33.75 
 
 		 514 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  36.19 
 
 		 507 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  32.84 
 
 		 520 aa  257  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  34.04 
 
 		 527 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.47 
 
 		 508 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  34.07 
 
 		 499 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  36.34 
 
 		 531 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  33.87 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.76 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  34.81 
 
 		 518 aa  250  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.87 
 
 		 499 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  35.89 
 
 		 515 aa  249  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  34.32 
 
 		 508 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 524 aa  250  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  35.42 
 
 		 505 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  32.68 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 505 aa  249  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  35.42 
 
 		 508 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  32.64 
 
 		 492 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  35.22 
 
 		 505 aa  247  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  31.22 
 
 		 511 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  35.08 
 
 		 508 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  36.56 
 
 		 502 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  32.12 
 
 		 504 aa  246  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  33.12 
 
 		 501 aa  246  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  31.36 
 
 		 522 aa  245  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  35.08 
 
 		 507 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  34.4 
 
 		 532 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  33.41 
 
 		 537 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 494 aa  244  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  32.48 
 
 		 501 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  34.04 
 
 		 496 aa  243  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  31.29 
 
 		 507 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  34.72 
 
 		 508 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 528 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  36.98 
 
 		 522 aa  243  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  34.07 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  33.82 
 
 		 525 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  32.99 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  34.34 
 
 		 543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  33.61 
 
 		 517 aa  240  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  33.86 
 
 		 543 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  30.85 
 
 		 517 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  32.98 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  30.43 
 
 		 507 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  34.73 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  31.33 
 
 		 537 aa  237  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  32.14 
 
 		 524 aa  238  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  31.62 
 
 		 506 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  33.81 
 
 		 543 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  34.35 
 
 		 513 aa  237  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  33.76 
 
 		 740 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  33.82 
 
 		 505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  32.08 
 
 		 497 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  33.96 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 512 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  33.83 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  31.61 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 543 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  31.67 
 
 		 507 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  33.8 
 
 		 511 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  32.22 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  33.97 
 
 		 510 aa  230  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  33.05 
 
 		 520 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  32.67 
 
 		 497 aa  230  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  34.05 
 
 		 502 aa  230  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  33.25 
 
 		 511 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  32.21 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>