264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3191 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  51.85 
 
 		 318 aa  268  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  52.1 
 
 		 330 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  52.1 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  53.22 
 
 		 359 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  54.08 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  51.68 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  52.79 
 
 		 357 aa  252  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  51.26 
 
 		 332 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  51.26 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  51.26 
 
 		 333 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  51.5 
 
 		 362 aa  251  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  53.15 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  47.1 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  43.62 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  42.62 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  44.26 
 
 		 267 aa  214  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  40.57 
 
 		 294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  47.41 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  45.87 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  40.43 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  43.86 
 
 		 334 aa  205  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  44.96 
 
 		 336 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  44.96 
 
 		 338 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  40.4 
 
 		 414 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  44.96 
 
 		 336 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  44.96 
 
 		 336 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  41.53 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  43.98 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  45.85 
 
 		 353 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  45.85 
 
 		 353 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  44 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  45.85 
 
 		 353 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  42.49 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  44.98 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  40.76 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  40.89 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  40.89 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  40.89 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  38.66 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  47.3 
 
 		 310 aa  188  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  44.91 
 
 		 286 aa  188  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  43.95 
 
 		 300 aa  188  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  38.66 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  40.34 
 
 		 292 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  41.15 
 
 		 277 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  42.8 
 
 		 292 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  40.59 
 
 		 351 aa  181  8.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  40.68 
 
 		 407 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  37.66 
 
 		 326 aa  178  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  40.08 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  40.68 
 
 		 316 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  38.08 
 
 		 306 aa  176  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  36.78 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  41.52 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  38.14 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  42.41 
 
 		 367 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  42.41 
 
 		 367 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  42.41 
 
 		 367 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  42.41 
 
 		 367 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  42.41 
 
 		 367 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  42.41 
 
 		 367 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  42.41 
 
 		 367 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  42.41 
 
 		 361 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  42.41 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3686  rod shape-determining protein MreC  42.41 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000135967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  40.08 
 
 		 383 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3636  rod shape-determining protein MreC  41.96 
 
 		 350 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3733  rod shape-determining protein MreC  41.96 
 
 		 350 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0325244  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3565  rod shape-determining protein MreC  41.96 
 
 		 350 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3671  rod shape-determining protein MreC  41.96 
 
 		 350 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208863  normal  0.389982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3564  rod shape-determining protein MreC  41.96 
 
 		 350 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00821336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0253  rod shape-determining protein MreC  41.07 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00109654  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  39.25 
 
 		 302 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  39.25 
 
 		 302 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  40.18 
 
 		 327 aa  165  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  38.98 
 
 		 448 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  36.24 
 
 		 288 aa  161  8.000000000000001e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  39.64 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  34.73 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  33.89 
 
 		 286 aa  158  9e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  37.92 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  34.55 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  35.92 
 
 		 311 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  36.96 
 
 		 369 aa  144  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  36.09 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  36.28 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  35.96 
 
 		 346 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  37.29 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  35.35 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  36.09 
 
 		 369 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  36.62 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  36.09 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  35.78 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  33.48 
 
 		 307 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  35.65 
 
 		 357 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>