37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2857 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  100 
 
 		 1208 aa  2460    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  35.11 
 
 		 855 aa  60.1  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  35.71 
 
 		 833 aa  57  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.32 
 
 		 742 aa  56.2  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  26.17 
 
 		 694 aa  56.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  40.24 
 
 		 994 aa  55.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  39.13 
 
 		 665 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  34.78 
 
 		 972 aa  55.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 912 aa  55.1  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.24 
 
 		 1217 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  37.08 
 
 		 746 aa  53.5  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5023  PE-PGRS family protein  47.76 
 
 		 636 aa  52.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0598462  normal  0.091778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  41.46 
 
 		 665 aa  51.6  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  30.85 
 
 		 848 aa  50.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.11 
 
 		 1293 aa  51.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  38.71 
 
 		 1376 aa  50.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  33.06 
 
 		 1750 aa  50.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  41.38 
 
 		 1265 aa  50.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  39.22 
 
 		 635 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  35.45 
 
 		 1022 aa  49.3  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  35.29 
 
 		 634 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  29.37 
 
 		 850 aa  48.5  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  29.7 
 
 		 3278 aa  47.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  30.67 
 
 		 1011 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.47 
 
 		 1212 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  32.22 
 
 		 848 aa  47.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  42.67 
 
 		 994 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  33 
 
 		 985 aa  47.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  35.23 
 
 		 1258 aa  46.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  38.24 
 
 		 635 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  39.02 
 
 		 1084 aa  46.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3634  hypothetical protein  26.77 
 
 		 482 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  hitchhiker  0.000640384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1011 aa  45.8  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  33.71 
 
 		 868 aa  46.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  38.55 
 
 		 902 aa  46.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  32.93 
 
 		 820 aa  45.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  29.61 
 
 		 506 aa  45.1  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>