124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1537 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  100 
 
 		 162 aa  333  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  38.99 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3022  hypothetical protein  39.74 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.379437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2361  hypothetical protein  37.09 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000028  hemolysin-coregulated protein  36.42 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.75 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3068  hypothetical protein  27.95 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  28.4 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.92 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  27.33 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.3 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  30.63 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  30.63 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  30.82 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  30.63 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.06 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  30 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  32.73 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  27.71 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  27.71 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  28.48 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  32.12 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  27.71 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  25.93 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  25.93 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  25.93 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  25.93 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  25.93 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  25.93 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  25.93 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  29.38 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  30.66 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  27.88 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  27.52 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  30.82 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  27.22 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.22 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  30.14 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  31.29 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2928  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.58 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.16 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  30.97 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3561  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00586235  normal  0.966398 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2637  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0383  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.211293  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0469  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000529011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0447  Hcp1 family type VI secretion system effector  30 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406517  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0404  Hcp1 family type VI secretion system effector  30 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000425347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.77 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  31.1 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.79 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  25.79 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  25.79 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0440  hypothetical protein  24.4 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  27.95 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0747  hypothetical protein  24.4 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1042  hypothetical protein  24.4 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2016  hypothetical protein  24.4 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  29.11 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  24.4 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  29.11 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  27.52 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  27.67 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2076  hypothetical protein  23.81 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  27.67 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  27.74 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0791  hypothetical protein  23.81 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0702  hypothetical protein  23.81 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  27.74 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  27.67 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  27.67 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3642  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  27.89 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3633  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3658  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  26.67 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  27.22 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  26.58 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  24.68 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  24.68 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2962  hypothetical protein  29.29 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  24.68 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  25.32 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  24.68 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  24.68 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  24.05 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  23.57 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  23.57 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  23.57 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  23.57 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  23.57 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  23.57 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  23.57 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  27.27 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  28.48 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  24.68 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  26.25 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  27.27 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.27 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  28.22 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>