72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000028 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000028  hemolysin-coregulated protein  100 
 
 		 159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2361  hypothetical protein  79.87 
 
 		 159 aa  265  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  37.41 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  36.42 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3022  hypothetical protein  32.65 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.379437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3068  hypothetical protein  33.79 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.9 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  27.85 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  25.16 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  25.16 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  25.16 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  25.16 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  29.41 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  25.16 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  24.52 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  29.85 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  29.85 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  29.85 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  29.85 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  29.85 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  29.85 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  29.85 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  27.14 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  29.84 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  26.87 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  26.87 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  25.33 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.43 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  24.5 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  26.87 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  28.36 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  29.84 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  26.87 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  23.87 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.36 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  30.3 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  22.88 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  24 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  24.63 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  24.03 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  25.37 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  26.87 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  26.87 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  25.37 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  25.37 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  25.37 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  28.78 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.87 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  26.75 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  26.09 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  28.68 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  26.75 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.21 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  25.48 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  27.61 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  25.97 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  24.81 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  24.26 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0741  hemolysin-coregulated protein (uncharacterized)-like protein  25.95 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  22.84 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.74 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.12 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  25.58 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  43.9  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  21.19 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  24.32 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  23.66 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  24.26 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  28.67 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  24.82 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0397493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>