124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3217 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  98.83 
 
 
513 aa  1063    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  99.61 
 
 
513 aa  1069    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  100 
 
 
513 aa  1073    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  49.13 
 
 
508 aa  485  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  46.18 
 
 
508 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  46.5 
 
 
507 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  45.49 
 
 
507 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  47.95 
 
 
508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  45.49 
 
 
507 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  45.35 
 
 
518 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  45.24 
 
 
524 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  43.49 
 
 
522 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  43.5 
 
 
526 aa  445  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  43.07 
 
 
537 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  44.1 
 
 
514 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  42.14 
 
 
508 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  43.41 
 
 
524 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  42.07 
 
 
524 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  42.88 
 
 
524 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  43.5 
 
 
517 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  40.69 
 
 
525 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  42.86 
 
 
514 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  40 
 
 
528 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  44.31 
 
 
507 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  39.02 
 
 
543 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  40.04 
 
 
543 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  41.27 
 
 
532 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  42.66 
 
 
507 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  40.53 
 
 
513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  40.84 
 
 
527 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  39.02 
 
 
543 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  39.21 
 
 
543 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  42.77 
 
 
515 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  40.75 
 
 
531 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  40.38 
 
 
520 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  42.38 
 
 
510 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  40.19 
 
 
537 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  40.96 
 
 
522 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  41.9 
 
 
511 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  41.74 
 
 
505 aa  382  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  38.15 
 
 
517 aa  379  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  37.72 
 
 
520 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  36.7 
 
 
529 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  37.53 
 
 
529 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  34.71 
 
 
498 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.79 
 
 
508 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.27 
 
 
508 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.86 
 
 
505 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  33.91 
 
 
538 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  33.91 
 
 
538 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.12 
 
 
538 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  31.85 
 
 
538 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  31.85 
 
 
538 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  31.85 
 
 
538 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34.5 
 
 
497 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.55 
 
 
537 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  35.86 
 
 
515 aa  250  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  35.33 
 
 
503 aa  247  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  36.88 
 
 
496 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  31.84 
 
 
512 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  34.99 
 
 
497 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  34.37 
 
 
502 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  32.38 
 
 
501 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  33.41 
 
 
506 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  32.87 
 
 
509 aa  236  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  31.96 
 
 
505 aa  236  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.88 
 
 
517 aa  236  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  32.94 
 
 
494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  35.03 
 
 
507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  34.39 
 
 
495 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  32.94 
 
 
492 aa  233  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  36.32 
 
 
504 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  32.17 
 
 
510 aa  232  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  33.71 
 
 
501 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  32.61 
 
 
496 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  32.55 
 
 
523 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  35.81 
 
 
740 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  33.56 
 
 
501 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  34.39 
 
 
501 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  32.35 
 
 
504 aa  229  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  33.41 
 
 
503 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  32.59 
 
 
511 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  33.9 
 
 
506 aa  227  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  33.01 
 
 
500 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  35.16 
 
 
501 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  32.48 
 
 
499 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.79 
 
 
501 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  33.86 
 
 
499 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
502 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  32.35 
 
 
518 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.62 
 
 
499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  32.28 
 
 
499 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  32.06 
 
 
505 aa  219  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  32.67 
 
 
503 aa  219  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  34.08 
 
 
502 aa  220  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  31.97 
 
 
502 aa  219  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  33.64 
 
 
507 aa  219  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  32.69 
 
 
500 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  31.85 
 
 
497 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
510 aa  219  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>