38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4700 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4700  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  1003    Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  25.94 
 
 		 590 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  25.94 
 
 		 590 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  25.94 
 
 		 590 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  25.94 
 
 		 590 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  25.94 
 
 		 590 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  25.59 
 
 		 888 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  24.7 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  23.7 
 
 		 878 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.54 
 
 		 572 aa  57  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  22.8 
 
 		 578 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  24.49 
 
 		 569 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  24.49 
 
 		 545 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  22.26 
 
 		 566 aa  53.5  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  21.93 
 
 		 559 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  25.12 
 
 		 556 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  22.76 
 
 		 569 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  24.67 
 
 		 551 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4232  lipoprotein  21.86 
 
 		 540 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634077 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5437  type IV secretion pathway protein  28.81 
 
 		 561 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.357309  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5031  PilN  28.81 
 
 		 561 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.41 
 
 		 561 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.41 
 
 		 561 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.41 
 
 		 561 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5663  type IVB pilus formation outer membrane protein  22.18 
 
 		 577 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603962  normal  0.0114433 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  33.33 
 
 		 563 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  33.33 
 
 		 563 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  22.18 
 
 		 577 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  21.9 
 
 		 538 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  24.09 
 
 		 530 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.41 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.41 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.73 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.73 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  25.84 
 
 		 547 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  22.18 
 
 		 560 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4402  type II and III secretion system protein  23.74 
 
 		 622 aa  43.5  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  30.67 
 
 		 569 aa  43.5  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>