299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1137 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  100 
 
 		 316 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  97.2 
 
 		 321 aa  626  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  96.26 
 
 		 321 aa  623  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  98.13 
 
 		 321 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  97.82 
 
 		 321 aa  607  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  98.13 
 
 		 321 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  97.2 
 
 		 321 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  97.2 
 
 		 321 aa  600  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  75.39 
 
 		 321 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  75.7 
 
 		 321 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  75.7 
 
 		 321 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  75.39 
 
 		 321 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  75.39 
 
 		 321 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  67.38 
 
 		 325 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  66.77 
 
 		 325 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  37.97 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  32.43 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  33.33 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  29.01 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  31.83 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  33.67 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  33.22 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  29.39 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  30.43 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  28.08 
 
 		 374 aa  99  9e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  30.5 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  31.79 
 
 		 308 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  29.07 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  27.54 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  25.59 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.81 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  24.34 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  25.16 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  24.52 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  26.64 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  22.83 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  24.85 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.21 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  27.39 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  21.4 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  26.75 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  26.47 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  26.79 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  24.91 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  27.8 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  22.93 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  23.92 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  26.95 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0329  ribokinase-like domain-containing protein  24.21 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.810022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  25.93 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  27.35 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  27.87 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  20.82 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  20.82 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  20.82 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  27.39 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  23.2 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  28.09 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  26.34 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  24.09 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  24.09 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  24.01 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  27.39 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  23.59 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  27.8 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  26.44 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  25.56 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  28.22 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  25.23 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  25.19 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  26.37 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  22.39 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.11 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  26.76 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  24.92 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  24.73 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  25.26 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.2 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  27.54 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  25.71 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  26.74 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>