60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1018 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  100 
 
 		 89 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  94.19 
 
 		 89 aa  166  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  94.19 
 
 		 88 aa  166  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  93.51 
 
 		 82 aa  149  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  83.33 
 
 		 247 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  81.97 
 
 		 193 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  81.67 
 
 		 194 aa  97.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  81.67 
 
 		 194 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  82.26 
 
 		 194 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  80 
 
 		 194 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  80 
 
 		 191 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  80 
 
 		 191 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  80 
 
 		 191 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  80 
 
 		 191 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  71.67 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  43.88 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  60.38 
 
 		 190 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  63.46 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  61.67 
 
 		 193 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  61.67 
 
 		 193 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  62.26 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  60 
 
 		 189 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  60 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  60 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  88.89 
 
 		 36 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  55 
 
 		 442 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  51.79 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  55 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  55 
 
 		 192 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  55 
 
 		 293 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1883  hypothetical protein  49.18 
 
 		 199 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156708 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  63.04 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  56.36 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  54.39 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1636  tail fiber assembly protein, truncation  89.66 
 
 		 30 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269715  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  60.53 
 
 		 47 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  52 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  52.63 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  53.06 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  57.78 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  56.36 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2467  DNA polymerase V subunit  70.59 
 
 		 223 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.000992934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  60.42 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  54.17 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  50 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  47.17 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  41.54 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  53.33 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  49.12 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  40 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  44.44 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  51.02 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2077  hypothetical protein  51.35 
 
 		 67 aa  43.9  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10705e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  48 
 
 		 198 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  38.18 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  48.08 
 
 		 209 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  41.67 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  44.83 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>