More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1742 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1742  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  100 
 
 
318 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1315  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  50.5 
 
 
325 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213416  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0554  ribosomal L11 methyltransferase  51.61 
 
 
323 aa  265  8.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2435  ribosomal L11 methyltransferase  45.7 
 
 
310 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.299408  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1227  ribosomal L11 methyltransferase  39.77 
 
 
291 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0558  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39 
 
 
291 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2210  ribosomal L11 methyltransferase  39 
 
 
291 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928859  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2376  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.6 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06603  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2054  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.7 
 
 
297 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.118265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1759  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.81 
 
 
298 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1417  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.97 
 
 
285 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2834  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.13 
 
 
292 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.0556009 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0622  ribosomal L11 methyltransferase  37.21 
 
 
289 aa  155  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2573  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
292 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.316492  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.55 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  36.36 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0961  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  40.72 
 
 
290 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  35.63 
 
 
289 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2857  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.12 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2089  ribosomal L11 methyltransferase  36.86 
 
 
306 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.26 
 
 
290 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.78676  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0744  ribosomal L11 methyltransferase  37.55 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3290  ribosomal L11 methyltransferase  37.5 
 
 
296 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.448463  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0776  ribosomal L11 methyltransferase  34.51 
 
 
300 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374062  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2060  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.08 
 
 
286 aa  124  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2746  ribosomal L11 methyltransferase  38.99 
 
 
298 aa  122  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4993  ribosomal L11 methyltransferase  35.18 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135783  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2367  ribosomal L11 methyltransferase  39.09 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.234607  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3377  ribosomal L11 methyltransferase  37.22 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288967  decreased coverage  0.00145631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4031  ribosomal L11 methyltransferase  38.39 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0295987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2866  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.87 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6159  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  37.04 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0834072  normal  0.0516426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4479  ribosomal L11 methyltransferase  35.66 
 
 
305 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.04 
 
 
287 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.04 
 
 
287 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.38 
 
 
287 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4944  ribosomal L11 methyltransferase  34.25 
 
 
305 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.478731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0217  ribosomal L11 methyltransferase  37.12 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2012  ribosomal L11 methyltransferase  37.18 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.255212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.24 
 
 
307 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2334  ribosomal L11 methyltransferase  35.83 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.783538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1424  ribosomal L11 methyltransferase  40.19 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1746  ribosomal L11 methyltransferase  37.74 
 
 
309 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0373  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.18 
 
 
292 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0981448 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0194  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.18 
 
 
292 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.27 
 
 
286 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.19 
 
 
299 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.19 
 
 
299 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.67 
 
 
294 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.48 
 
 
290 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0212  ribosomal L11 methyltransferase  39.13 
 
 
301 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0793007 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  34.8 
 
 
282 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06940  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
292 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.51 
 
 
283 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  35.43 
 
 
286 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.86 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.77 
 
 
290 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  28.14 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2055  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.51 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64140  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.52 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258424  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.91 
 
 
303 aa  94  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4290  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.47 
 
 
315 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.35 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5570  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.65 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.5 
 
 
293 aa  93.2  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.5 
 
 
293 aa  93.2  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.5 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.54 
 
 
327 aa  92.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.05 
 
 
295 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.31 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2244  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.56 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.924831  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.47 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1998  ribosomal L11 methyltransferase  31.96 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.831895  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.96 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.58 
 
 
293 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.05 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  34 
 
 
296 aa  90.1  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0920  ribosomal L11 methyltransferase  32.89 
 
 
283 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4818  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.84 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.983059  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.33 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4608  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.4 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.08 
 
 
293 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4693  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.84 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.35 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3224  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.48 
 
 
295 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.105508  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  31.9 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.08 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1496  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.15 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0608  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.21 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217984  hitchhiker  0.0000000198415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.88 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.25 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.3 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.84 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.77 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4871  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.4 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.89 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.63 
 
 
296 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.65 
 
 
293 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.04 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>