244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0901 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0901  ATPase  100 
 
 		 204 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  42.23 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  39.49 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  34.52 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  34.74 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  33.8 
 
 		 237 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  33.64 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  35.21 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  31.88 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  34.01 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  32.58 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  31.19 
 
 		 229 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  31.55 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  31.55 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  32.7 
 
 		 226 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  35.06 
 
 		 228 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  28.5 
 
 		 229 aa  84.7  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  31.55 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  35.05 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  31.78 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  37.12 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  30.62 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  29.19 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  33.68 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  30.05 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  35.11 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  29.86 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  33.99 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  29.77 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  28.64 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  27.83 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  32.18 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  27.83 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  32.18 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  36.13 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  31.19 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  36.13 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1717  hypothetical protein  36.76 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  36.76 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  30.69 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  35.59 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  35.59 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  35.59 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  27.36 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  36.44 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  28.79 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  36.44 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  34.19 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  36.44 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  35.59 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  34.48 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  29.57 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3953  DnaA regulatory inactivator Hda  32.9 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0746  DnaA regulatory inactivator Hda  32.9 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.653326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  29.86 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  36.44 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  26.2 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1576  DnaA regulatory inactivator Hda  36.84 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.298764  hitchhiker  0.00654895 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  33.61 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1901  hypothetical protein  36.84 
 
 		 236 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.198388  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  37.38 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  30.39 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2775  DnaA regulatory inactivator Hda  33.33 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00936325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3184  DNA replication initiation factor  30.08 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  26.74 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0673  DnaA regulatory inactivator Hda  32.58 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1132  DNA replication initiation factor  30.3 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  28.57 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1067  DNA replication initiation factor  30.08 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  29.55 
 
 		 455 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2616  DnaA regulatory inactivator Hda  33.33 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  29.55 
 
 		 455 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  29.55 
 
 		 461 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2110  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  33.88 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.519557  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1343  DNA replication initiation factor  28.7 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000127246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3269  DnaA regulatory inactivator Hda  31.78 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0915676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3302  DnaA regulatory inactivator Hda  31.78 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2318  DnaA regulatory inactivator Hda  31.78 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3312  DnaA regulatory inactivator Hda  31.78 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1316  DnaA regulatory inactivator Hda  31.78 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0581271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2487  chromosomal replication initiator, DnaA  29.55 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2197  DnaA regulatory inactivator Hda  31.78 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0509  DnaA regulatory inactivator Hda  31.78 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.679706  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1090  DnaA regulatory inactivator Hda  31.78 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02388  DNA replication initiation factor  30.65 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1173  DnaA regulatory inactivator Hda  30.65 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00363629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2779  DNA replication initiation factor  30.65 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00316092  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  32.52 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  32.52 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1180  DNA replication initiation factor  30.65 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02350  hypothetical protein  30.65 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0140211  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2643  DNA replication initiation factor  30.65 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.029874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2631  DNA replication initiation factor  30.65 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.127472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3718  DNA replication initiation factor  30.65 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2870  DNA replication initiation factor  30.65 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2489  DnaA regulatory inactivator Hda  31.61 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2989  DNA replication initiation factor  29.32 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>