35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0633 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  35.94 
 
 		 234 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  33.33 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  31.86 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  31.28 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  38.1 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  34.92 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  37.69 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  33.7 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  35.57 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  31.1 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  35.25 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  41.24 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  30.36 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  39.18 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  29.95 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  35.34 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  39.42 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  28.84 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3844  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  29.86 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  30.14 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  36.63 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  35.58 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  25.23 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  29.38 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  36.99 
 
 		 301 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  36.63 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  28.37 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  41.76 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0764  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 79 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0359167  normal  0.203575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 72 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  30.37 
 
 		 214 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>