74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0251 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 72 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 71 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 73 aa  98.2  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  62.32 
 
 		 76 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  64.62 
 
 		 74 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  60.61 
 
 		 71 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  56.72 
 
 		 68 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  55.56 
 
 		 68 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  54.41 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  49.25 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 89 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2870  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000158683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0816  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0066  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5017  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4838  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2358  hypothetical protein  35.06 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081812  decreased coverage  0.0000157362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  34.78 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1496  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000868778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0302  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0764  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0359167  normal  0.203575 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5453  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  22.39 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  27.94 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2963  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.364459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0997  transcriptional regulator, XRE family  25.4 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2853  putative transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2806  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0630  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.054738  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5459  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0131549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3037  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2649  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  36.07 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1464  hypothetical protein  27.87 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1982  transcriptional regulator, XRE family  25.4 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.995083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0305  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00365078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1322  hypothetical protein  23.08 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117292  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  24.59 
 
 		 71 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2665  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 		 74 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 70 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 69 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2733  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 		 70 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  23.08 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5346  putative transcriptional regulator, XRE family  27.94 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0937  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.792674  normal  0.0631359 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  23.81 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  22.95 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  22.95 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  22.95 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1336  hypothetical protein  30.88 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.94784  normal  0.842689 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  22.95 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28080  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00426893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4792  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0662158  normal  0.716445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0418  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007588  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3040  DNA-binding protein  22.22 
 
 		 71 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.119109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>