More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0327 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  35.8 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  35.67 
 
 		 196 aa  91.3  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  36.81 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  37.36 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.04 
 
 		 198 aa  85.1  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  37.64 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0462  Phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  40 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  36.31 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  42.5 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  28.34 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.56 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  35.2 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  37.8 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.89 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  43.04 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  37.63 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  44.1 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.82 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  31.41 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  34.97 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  43.04 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 366 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  39.61 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.46 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.14 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  34.68 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 234 aa  72  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  34.97 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.26 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.52 
 
 		 427 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  32.4 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  30.43 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  34.76 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8239  putative phosphoglycerate mutase  38.71 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  35.71 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  28.43 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  31.33 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  28.43 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  24.86 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  32.61 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  27.22 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  24.28 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  26.74 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  28.09 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>