More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1799 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
200 aa  383  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  95 
 
 
200 aa  343  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  59 
 
 
200 aa  214  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  60.7 
 
 
200 aa  211  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.98 
 
 
212 aa  208  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.41 
 
 
202 aa  206  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.22 
 
 
202 aa  202  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  56.37 
 
 
199 aa  194  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.34 
 
 
206 aa  191  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.96 
 
 
198 aa  189  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  57.3 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  52.76 
 
 
196 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  55.17 
 
 
206 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  56.37 
 
 
202 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.78 
 
 
197 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  54.37 
 
 
206 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.11 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.15 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.77 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  52.66 
 
 
209 aa  178  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.27 
 
 
196 aa  174  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.27 
 
 
196 aa  174  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.27 
 
 
196 aa  174  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.74 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.08 
 
 
209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.2 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  54.5 
 
 
239 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.29 
 
 
205 aa  159  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.1 
 
 
200 aa  158  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.38 
 
 
214 aa  153  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  49 
 
 
199 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.86 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.98 
 
 
195 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.46 
 
 
195 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.79 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.71 
 
 
195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  37.44 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  37.98 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.43 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  42.03 
 
 
205 aa  124  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.61 
 
 
197 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.44 
 
 
197 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.63 
 
 
200 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
197 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.89 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.59 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.45 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.9 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  39.78 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.61 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.94 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.93 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.93 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.89 
 
 
194 aa  115  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.38 
 
 
205 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.13 
 
 
201 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  37.79 
 
 
194 aa  115  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.86 
 
 
205 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
198 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.96 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.64 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.57 
 
 
202 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.78 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
199 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
199 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.8 
 
 
205 aa  111  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.63 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  34.01 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.25 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.25 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  37 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.57 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.57 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
202 aa  109  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.05 
 
 
205 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.92 
 
 
201 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.14 
 
 
187 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  34.41 
 
 
203 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.57 
 
 
205 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  34.62 
 
 
206 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.69 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.97 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.94 
 
 
204 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.05 
 
 
205 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.64 
 
 
199 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.64 
 
 
199 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
199 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.46 
 
 
199 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.87 
 
 
205 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1212  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.27 
 
 
205 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.44 
 
 
195 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>