208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1488 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  85.66 
 
 
542 aa  909    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  100 
 
 
522 aa  1050    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  46.57 
 
 
518 aa  392  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  43.82 
 
 
540 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  42.21 
 
 
527 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  37.52 
 
 
495 aa  307  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  41.31 
 
 
500 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  39.79 
 
 
506 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  41.09 
 
 
485 aa  293  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  39.66 
 
 
523 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  38.96 
 
 
508 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  36.87 
 
 
524 aa  282  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  40.33 
 
 
542 aa  280  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  37.07 
 
 
521 aa  279  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  37.55 
 
 
537 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  39.48 
 
 
515 aa  277  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  39.09 
 
 
507 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  38.82 
 
 
525 aa  276  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  39.18 
 
 
511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  39.18 
 
 
511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  39.18 
 
 
511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  35.74 
 
 
522 aa  273  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  38.71 
 
 
515 aa  272  8.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  37.28 
 
 
521 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  39.61 
 
 
495 aa  272  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  36.7 
 
 
521 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  38.53 
 
 
516 aa  270  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  35.7 
 
 
525 aa  268  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  38.68 
 
 
541 aa  266  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  35.96 
 
 
545 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  38.08 
 
 
538 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  39.19 
 
 
520 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  35.36 
 
 
518 aa  260  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  32.72 
 
 
546 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  37.18 
 
 
551 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  36.55 
 
 
533 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  36.55 
 
 
508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  36.55 
 
 
508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  34.3 
 
 
520 aa  229  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 
505 aa  228  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  32.52 
 
 
499 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  34.13 
 
 
476 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  31.34 
 
 
544 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  33.8 
 
 
505 aa  206  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  31.77 
 
 
504 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  33.66 
 
 
643 aa  197  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  33.27 
 
 
535 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  35.63 
 
 
535 aa  193  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  29.65 
 
 
504 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  32.19 
 
 
564 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  30.97 
 
 
514 aa  191  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  33.33 
 
 
518 aa  191  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  34.15 
 
 
557 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  29.96 
 
 
530 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  30.43 
 
 
505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  32.46 
 
 
532 aa  180  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  30.16 
 
 
515 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  34.68 
 
 
551 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  30.77 
 
 
524 aa  173  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  30.69 
 
 
508 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  32.23 
 
 
571 aa  170  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  29.52 
 
 
506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  29.55 
 
 
505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  29.1 
 
 
555 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  28.12 
 
 
542 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  29.39 
 
 
486 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  30.95 
 
 
547 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  27.87 
 
 
478 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  28.87 
 
 
532 aa  157  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  27.78 
 
 
505 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
486 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  28.51 
 
 
514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  31.4 
 
 
504 aa  144  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  30.25 
 
 
517 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  36.48 
 
 
597 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  28.95 
 
 
750 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  26.62 
 
 
494 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  29.31 
 
 
556 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  24.17 
 
 
597 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  29.71 
 
 
524 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  39 
 
 
300 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  30.64 
 
 
539 aa  134  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  29.25 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  27.4 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  30.3 
 
 
546 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  29.68 
 
 
493 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2489  TAP domain-containing protein  27.17 
 
 
519 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.322289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  28.16 
 
 
484 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3914  TAP domain-containing protein  25.45 
 
 
519 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.527163  normal  0.822119 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  26.63 
 
 
678 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  33.33 
 
 
520 aa  124  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  27.49 
 
 
521 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  26.65 
 
 
459 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  27.02 
 
 
613 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  28.31 
 
 
536 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  27.02 
 
 
623 aa  120  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  25.51 
 
 
527 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
525 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  28.18 
 
 
559 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2218  TAP-like protein  26.95 
 
 
520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>