113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3914 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2218  TAP-like protein  75.1 
 
 		 520 aa  766    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2264  TAP domain-containing protein  75.1 
 
 		 520 aa  766    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2489  TAP domain-containing protein  90.75 
 
 		 519 aa  937    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2207  TAP domain-containing protein  75.1 
 
 		 520 aa  766    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3914  TAP domain-containing protein  100 
 
 		 519 aa  1038    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.527163  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12687  protease  67.93 
 
 		 525 aa  639    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.68e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2270  hypothetical protein  35.99 
 
 		 517 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.983408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1897  TAP domain protein  35.83 
 
 		 520 aa  237  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  29.74 
 
 		 514 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  28.04 
 
 		 514 aa  134  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  26.02 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  27.97 
 
 		 518 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  25.35 
 
 		 522 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  26.33 
 
 		 522 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  26.5 
 
 		 540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  25.4 
 
 		 546 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  29.17 
 
 		 524 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  25 
 
 		 515 aa  92.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  25.31 
 
 		 495 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  25.41 
 
 		 506 aa  87.4  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  27.08 
 
 		 476 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  23.59 
 
 		 541 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  24.43 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  24.42 
 
 		 542 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  24.31 
 
 		 524 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  24.65 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  32.02 
 
 		 675 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  23.28 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  24.62 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  23.98 
 
 		 536 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  23.76 
 
 		 515 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  23.73 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  22.81 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  25.74 
 
 		 527 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  23.99 
 
 		 613 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  24.68 
 
 		 508 aa  67  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  26.01 
 
 		 486 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  26.25 
 
 		 557 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  23.08 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  23.4 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  23.4 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  23.4 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  22.36 
 
 		 545 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  24.22 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  25.54 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  25.22 
 
 		 525 aa  62  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  24.71 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  26.07 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  24.26 
 
 		 542 aa  58.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  25.6 
 
 		 520 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  23.36 
 
 		 507 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  21.93 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  27.06 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  24.74 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  22.77 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  26.65 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  24.49 
 
 		 533 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  28.83 
 
 		 521 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  29.05 
 
 		 533 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  29.05 
 
 		 508 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  29.05 
 
 		 508 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  22.61 
 
 		 533 aa  53.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  22.29 
 
 		 504 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  25.41 
 
 		 532 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  21.62 
 
 		 519 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  28.75 
 
 		 542 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  23.31 
 
 		 525 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  23.6 
 
 		 539 aa  50.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  25.51 
 
 		 521 aa  50.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  24.44 
 
 		 527 aa  50.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  23.27 
 
 		 538 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  33.58 
 
 		 532 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  26.86 
 
 		 508 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  26.71 
 
 		 517 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 		 480 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  24.51 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  23.44 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  21.33 
 
 		 499 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  27.69 
 
 		 546 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  27.54 
 
 		 597 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  23.63 
 
 		 551 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  45.59 
 
 		 337 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  26.33 
 
 		 750 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  25.07 
 
 		 493 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  23.39 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  42.19 
 
 		 270 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  24.79 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  25.58 
 
 		 539 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  24.19 
 
 		 507 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  25.38 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  21.99 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  25.38 
 
 		 545 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  25 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  27.48 
 
 		 538 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  25.38 
 
 		 549 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  21.84 
 
 		 544 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  21.98 
 
 		 486 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>