100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12687 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3914  TAP domain-containing protein  67.93 
 
 
519 aa  693    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.527163  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2207  TAP domain-containing protein  66.6 
 
 
520 aa  656    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2218  TAP-like protein  66.6 
 
 
520 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2489  TAP domain-containing protein  70.32 
 
 
519 aa  713    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.322289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12687  protease  100 
 
 
525 aa  1051    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.68e-19  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2264  TAP domain-containing protein  66.6 
 
 
520 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149819  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2270  hypothetical protein  35.4 
 
 
517 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.983408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1897  TAP domain protein  38.45 
 
 
520 aa  243  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  32.06 
 
 
514 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  28.68 
 
 
518 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  29.06 
 
 
514 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  26.81 
 
 
542 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  28.29 
 
 
540 aa  128  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  26.22 
 
 
522 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  26.08 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  27.59 
 
 
495 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  28.87 
 
 
524 aa  103  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  24.85 
 
 
541 aa  90.9  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  24.9 
 
 
524 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  25.07 
 
 
546 aa  87.4  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  25.19 
 
 
521 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  27 
 
 
537 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  25.84 
 
 
507 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  23.4 
 
 
525 aa  80.5  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  24.24 
 
 
506 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  26.32 
 
 
516 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  24.55 
 
 
545 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  26.32 
 
 
525 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  25.45 
 
 
515 aa  77.8  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  22.94 
 
 
518 aa  76.3  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  25.37 
 
 
495 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  25 
 
 
515 aa  75.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  22.89 
 
 
536 aa  75.5  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  25.65 
 
 
520 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  25.76 
 
 
508 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 
505 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  25 
 
 
523 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  24.31 
 
 
511 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  24.31 
 
 
511 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  24.31 
 
 
511 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  23.14 
 
 
532 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  24.85 
 
 
557 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  27.3 
 
 
538 aa  68.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  24.02 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  31.21 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  24.94 
 
 
521 aa  67.4  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  28.09 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  31.21 
 
 
508 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  31.21 
 
 
508 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  27.27 
 
 
521 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  24.59 
 
 
527 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  22.04 
 
 
542 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  25.2 
 
 
476 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  23.31 
 
 
508 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  28.57 
 
 
520 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  24.49 
 
 
542 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  21.81 
 
 
499 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  28.06 
 
 
493 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  25.45 
 
 
485 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  24.95 
 
 
505 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  26.02 
 
 
300 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  23.99 
 
 
613 aa  62  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  23.13 
 
 
478 aa  60.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  22.55 
 
 
500 aa  60.1  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  21.6 
 
 
504 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
675 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  23.73 
 
 
486 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  21.83 
 
 
555 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  21.83 
 
 
504 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  24.6 
 
 
522 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  22.25 
 
 
597 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  23.91 
 
 
750 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
480 aa  53.5  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  24.44 
 
 
518 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  23.37 
 
 
533 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  32.95 
 
 
505 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  25.29 
 
 
494 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  24.65 
 
 
551 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  24.39 
 
 
564 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  21.64 
 
 
532 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  21.99 
 
 
505 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  24.62 
 
 
504 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  25.06 
 
 
557 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  25.25 
 
 
535 aa  47.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  25.13 
 
 
597 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  27.98 
 
 
556 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  23.14 
 
 
519 aa  47  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
480 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
645 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  22.71 
 
 
511 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  25.93 
 
 
542 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  27.61 
 
 
521 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  24.51 
 
 
532 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  21.32 
 
 
515 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  33.6 
 
 
766 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  23.44 
 
 
517 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  21.92 
 
 
643 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  26.72 
 
 
517 aa  43.9  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 
503 aa  43.5  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  26.45 
 
 
539 aa  43.5  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>