More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1430 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
511 aa  942    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  57.31 
 
 
515 aa  428  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  54.28 
 
 
502 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.79 
 
 
515 aa  352  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.44 
 
 
511 aa  345  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.75 
 
 
528 aa  323  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.43 
 
 
503 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.61 
 
 
514 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.4 
 
 
521 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.6 
 
 
521 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
536 aa  309  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.01 
 
 
518 aa  309  6.999999999999999e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 
530 aa  309  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.4 
 
 
521 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.27 
 
 
509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46 
 
 
521 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  46.28 
 
 
512 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 
536 aa  293  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
526 aa  289  7e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
526 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
526 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
541 aa  283  5.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.23 
 
 
521 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 
530 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.16 
 
 
522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.07 
 
 
500 aa  273  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
543 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
530 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
526 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 
534 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  44.09 
 
 
534 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
526 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
536 aa  257  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
527 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.96 
 
 
531 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  39.79 
 
 
513 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  40.34 
 
 
528 aa  248  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.34 
 
 
528 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 
528 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
536 aa  246  8e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
527 aa  244  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 
525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
523 aa  239  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
533 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
525 aa  238  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.66 
 
 
540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  43.95 
 
 
532 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
545 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
557 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
1057 aa  227  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.83 
 
 
530 aa  226  7e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
540 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.27 
 
 
559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  37.64 
 
 
507 aa  180  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
550 aa  177  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
562 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.99 
 
 
549 aa  167  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
530 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
562 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
568 aa  160  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  33.33 
 
 
553 aa  159  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
558 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  32.86 
 
 
559 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.92 
 
 
567 aa  155  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
570 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.98 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
557 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.7 
 
 
558 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
565 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
574 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  28.28 
 
 
541 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
550 aa  150  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
557 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  27.86 
 
 
541 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  34.23 
 
 
557 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 
538 aa  146  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
538 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2587  iron(III) ABC transporter, permease protein  27.68 
 
 
543 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.27 
 
 
506 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.61 
 
 
545 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
562 aa  144  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
544 aa  144  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
567 aa  143  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
558 aa  143  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
555 aa  143  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 
544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
565 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.086066  normal  0.404722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
560 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
560 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
544 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
582 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0138  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 
541 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000182315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
544 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
558 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
546 aa  139  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  34.26 
 
 
570 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1136  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  26.89 
 
 
532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  28.19 
 
 
564 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>