97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3437 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  39.64 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  39.64 
 
 		 245 aa  138  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  39.64 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  39.64 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  41.01 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  39.64 
 
 		 228 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  37.5 
 
 		 202 aa  134  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  38.6 
 
 		 234 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2267  hypothetical protein  35.74 
 
 		 248 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.311902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  39.01 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2225  hypothetical protein  42.79 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  38.42 
 
 		 206 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  38.89 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  29.95 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  28.43 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  29.9 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.26 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  32.18 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  29.06 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  27.84 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.43 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  25 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  28.57 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  27.78 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  29.59 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  23.98 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  28.65 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  28.12 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  25.59 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  28.43 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  29.02 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.28 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  32.16 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  35.08 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  30.3 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  28.27 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.52 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.75 
 
 		 538 aa  58.2  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  30.81 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  29.19 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  24.52 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.67 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  30.05 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  31.19 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  31.98 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.64 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  27.09 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  29.84 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.87 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  30.81 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  29.19 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  26.78 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  30.58 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28 
 
 		 539 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  28.28 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  25.79 
 
 		 575 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  29.76 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  25.98 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  24.12 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.94 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  29.76 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  28.1 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  29.76 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 544 aa  48.5  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.23 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5411  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.04 
 
 		 455 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026273 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  22.75 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  27.84 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27.32 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  30.21 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.14 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  28.49 
 
 		 534 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.74 
 
 		 538 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5429  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.51 
 
 		 455 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5293  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.51 
 
 		 455 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  28.1 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.47 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  29.17 
 
 		 534 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  27.17 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.44 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  26.24 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 		 367 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  26.99 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  27.83 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.72 
 
 		 533 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.87 
 
 		 533 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  28.14 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3456  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.27 
 
 		 455 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 372 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  28.69 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  28.21 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  27.18 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  27.98 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0044  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  23.59 
 
 		 459 aa  42  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.538697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>