More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3397 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  100 
 
 		 105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  64.71 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  63.11 
 
 		 107 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  62.14 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  62.14 
 
 		 107 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  62.14 
 
 		 107 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  62.14 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  61.17 
 
 		 107 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  61.17 
 
 		 107 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  61.17 
 
 		 107 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  59.22 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  51.46 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  40.38 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  40 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  37.96 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40.2 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  40.59 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  45.57 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  39.33 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  41.24 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  34.41 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  39.51 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  37.93 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.02 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  43.28 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  34.94 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.42 
 
 		 837 aa  61.6  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.9 
 
 		 550 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  34.88 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  37.18 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  42.47 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 82 aa  60.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  34.44 
 
 		 711 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  42.47 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  42.65 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  41.1 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  38.27 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  36.08 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0016  GlpE protein  27.5 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  41.43 
 
 		 277 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  33.78 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 188 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  41.18 
 
 		 186 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  41.18 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  35 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2346  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.64 
 
 		 549 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.705893  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  33.75 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.89 
 
 		 834 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.08 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  39.47 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  40.54 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  38.67 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  34.15 
 
 		 353 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  36.71 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  43.33 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>