209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1845 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  100 
 
 
243 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  70.37 
 
 
243 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  69.96 
 
 
243 aa  363  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  69.14 
 
 
252 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  69.14 
 
 
243 aa  360  9e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  69.55 
 
 
243 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  69.55 
 
 
243 aa  359  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  69.55 
 
 
243 aa  359  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  69.55 
 
 
243 aa  359  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  69.55 
 
 
243 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  67.49 
 
 
243 aa  352  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  67.9 
 
 
243 aa  347  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  67.49 
 
 
243 aa  344  7e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  66.67 
 
 
244 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  66.26 
 
 
243 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  66.26 
 
 
243 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  297  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  61 
 
 
246 aa  296  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  59.34 
 
 
247 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  297  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  297  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  297  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  297  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  59.34 
 
 
247 aa  296  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  58.92 
 
 
247 aa  295  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  58.92 
 
 
247 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  58.92 
 
 
247 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  61.34 
 
 
245 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  58.51 
 
 
247 aa  292  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  58.51 
 
 
247 aa  292  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  58.51 
 
 
247 aa  292  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  58.58 
 
 
246 aa  291  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  60.5 
 
 
245 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  58.58 
 
 
261 aa  289  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  58.7 
 
 
244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  58.58 
 
 
247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  58.44 
 
 
247 aa  285  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  57.08 
 
 
267 aa  285  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  57.08 
 
 
267 aa  285  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  57.08 
 
 
267 aa  285  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  56.79 
 
 
247 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  58.82 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  58.16 
 
 
241 aa  281  5.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  57.74 
 
 
247 aa  281  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  56.15 
 
 
244 aa  276  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  54.13 
 
 
245 aa  271  7e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  54.39 
 
 
251 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  54.92 
 
 
270 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  54.1 
 
 
267 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  53.53 
 
 
242 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  52.1 
 
 
244 aa  258  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  52.44 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  51.44 
 
 
243 aa  252  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  52.44 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  49.17 
 
 
243 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  51.63 
 
 
247 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  52.03 
 
 
268 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  53.36 
 
 
250 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  51.63 
 
 
247 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  49.17 
 
 
270 aa  243  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  50 
 
 
247 aa  241  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  50.41 
 
 
246 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  50 
 
 
247 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  49.59 
 
 
247 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  49.59 
 
 
247 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  49.39 
 
 
252 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  44.58 
 
 
245 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  46.22 
 
 
262 aa  206  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  45.68 
 
 
258 aa  204  8e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  46.8 
 
 
274 aa  202  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  44.22 
 
 
262 aa  198  7e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  37.82 
 
 
234 aa  161  9e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  38.91 
 
 
249 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  35.42 
 
 
288 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  36.97 
 
 
235 aa  155  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  34.73 
 
 
234 aa  153  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  34.58 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  36.4 
 
 
234 aa  150  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  36.4 
 
 
235 aa  149  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  34.31 
 
 
234 aa  148  9e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  36.4 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  37.66 
 
 
234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  35.39 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  35.98 
 
 
235 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  35 
 
 
234 aa  142  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  35 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  28.63 
 
 
242 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  28.72 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  28.29 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.17 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  37.5 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  24 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  38.18 
 
 
344 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  40 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.36 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.78 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>