More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1762 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1762  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117708  normal  0.0239338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2267  riboflavin synthase subunit alpha  69.65 
 
 		 205 aa  292  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00496217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2118  riboflavin synthase subunit alpha  67.66 
 
 		 210 aa  283  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.0673441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2495  riboflavin synthase subunit alpha  67.16 
 
 		 204 aa  280  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634088  hitchhiker  0.00287874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2036  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 203 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357361  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2030  riboflavin synthase subunit alpha  62.87 
 
 		 204 aa  276  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2296  riboflavin synthase subunit alpha  66.17 
 
 		 206 aa  275  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1952  riboflavin synthase subunit alpha  66.17 
 
 		 206 aa  275  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000576135  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2040  riboflavin synthase subunit alpha  66.17 
 
 		 206 aa  275  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000661862  normal  0.015006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2024  riboflavin synthase subunit alpha  66.17 
 
 		 206 aa  275  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0115302  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2333  riboflavin synthase subunit alpha  65.67 
 
 		 207 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0365218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2181  riboflavin synthase subunit alpha  65.67 
 
 		 207 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000128558  normal  0.0219696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2225  riboflavin synthase subunit alpha  65.67 
 
 		 207 aa  271  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2145  riboflavin synthase subunit alpha  65.17 
 
 		 207 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2020  riboflavin synthase subunit alpha  64.18 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.025182  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1703  riboflavin synthase subunit alpha  63.18 
 
 		 204 aa  261  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.043412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2674  riboflavin synthase subunit alpha  55.67 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2190  riboflavin synthase subunit alpha  54.77 
 
 		 216 aa  215  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00893234  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02237  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 203 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1751  riboflavin synthase subunit alpha  53.2 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2577  riboflavin synthase subunit alpha  53.2 
 
 		 218 aa  212  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1857  riboflavin synthase subunit alpha  53.2 
 
 		 218 aa  212  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2390  riboflavin synthase subunit alpha  54.68 
 
 		 211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1784  riboflavin synthase subunit alpha  50.74 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003523  lumazine protein  50.99 
 
 		 203 aa  205  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.942929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1713  riboflavin synthase subunit alpha  52 
 
 		 217 aa  204  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01633  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1978  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1681  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.665855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1535  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0455024  hitchhiker  0.00124186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01623  hypothetical protein  50.25 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1860  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000205404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1742  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000343227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1967  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.756733  hitchhiker  0.00000222488 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2375  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1876  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224926  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1940  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1917  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1748  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000886899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1522  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1559  riboflavin synthase subunit alpha  49.26 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1536  riboflavin synthase subunit alpha  49.26 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0812  riboflavin synthase subunit alpha  49.01 
 
 		 202 aa  198  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2099  riboflavin synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1383  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0087  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0316788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4731  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2867  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.999273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2113  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 235 aa  167  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2916  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2775  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2115  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.757101  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3429  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 		 238 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4077  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.578538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1243  riboflavin synthase, alpha subunit  41.06 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5723  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3144  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 236 aa  151  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1865  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8148  predicted protein  44.97 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.564807  normal  0.0620362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3729  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 237 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal  0.402908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4568  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 237 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3795  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 237 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4434  riboflavin synthase subunit alpha  42 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563917  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3686  riboflavin synthase subunit alpha  38.58 
 
 		 237 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0704066  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5522  riboflavin synthase subunit alpha  38.58 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189133  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  41.85 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  40.59 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2300  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 		 237 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.745499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  40.32 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  37.86 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  37.62 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  37.62 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  35.15 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  37.81 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  37.86 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  40.76 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  40.74 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  39.23 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  41.04 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  38.73 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  33.99 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  36.96 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  41.62 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  38.38 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0685  riboflavin synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 198 aa  121  9e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  37.62 
 
 		 220 aa  121  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  35.2 
 
 		 217 aa  121  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  37.13 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  36.87 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>