More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1107 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  100 
 
 		 199 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  47.69 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  47.18 
 
 		 196 aa  197  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  44.04 
 
 		 193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 214 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.39 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.03 
 
 		 442 aa  85.5  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.64 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.73 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.9 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  31.64 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30.9 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1440  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  31.07 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  35.8 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.51 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  30.51 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.73 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  36.77 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.2 
 
 		 442 aa  78.2  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  44.64 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.63 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.45 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.16 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 459 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.6 
 
 		 442 aa  71.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 370 aa  71.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.6 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0545  Phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.25 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.35 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.06 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1132  phosphoglycerate mutase  40.19 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.98 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  31.76 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>