More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2855 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  49.76 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  48.58 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  44.2 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  39.9 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  40.53 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  38.29 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  38.97 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  37.95 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  38.3 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  38.74 
 
 		 206 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  36.51 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  41.14 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  37.04 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  37.04 
 
 		 211 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  37.7 
 
 		 221 aa  92.8  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  34.92 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  35.45 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  35.18 
 
 		 211 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  35.03 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  30.12 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  33.15 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  33.73 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  34.01 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  32.63 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  35.26 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  32.74 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  32.51 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  33.15 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  40.12 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  32.74 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  32.74 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  39.16 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  32.93 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  32.74 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  32.74 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  38.78 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  32.74 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  32.74 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  32.74 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  33.88 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  33.85 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  32.6 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  33.91 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  36.75 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  33.7 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  36.47 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  31.58 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  34.52 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  40.44 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  33.52 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  33.13 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  32.4 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  34.44 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2570  methyltransferase GidB  31.85 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  32.45 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0895  methyltransferase GidB  30.6 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  31.84 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  28.66 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  32.61 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  31.32 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  28.05 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  28.05 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  28.66 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4908  16S rRNA methyltransferase GidB  30.64 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127096  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  36.54 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  26.11 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  36.69 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  37.93 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  28.05 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  34.46 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2231  methyltransferase GidB  38.36 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  28.92 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  32.43 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  30.37 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  36.13 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  35.83 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  33.51 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  30.29 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  35.66 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  30.29 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  30.29 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  30.29 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  30.29 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  34.09 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  30.29 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0044  16S rRNA methyltransferase GidB  27.64 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3786  16S rRNA methyltransferase GidB  30.81 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.393771  decreased coverage  0.000261644 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  29.61 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1127  glucose inhibited division protein B  28.05 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  30.49 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  35.66 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  31.33 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  28.05 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0001  16S rRNA methyltransferase GidB  30.29 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.895325  hitchhiker  0.000116578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>