234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2232 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  100 
 
 		 379 aa  766    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  69.09 
 
 		 372 aa  518  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  69.23 
 
 		 377 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  51.57 
 
 		 397 aa  335  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  52.43 
 
 		 373 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  51.1 
 
 		 358 aa  332  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  48.27 
 
 		 372 aa  326  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  48.7 
 
 		 395 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  49.48 
 
 		 381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  48.89 
 
 		 358 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  48.89 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  47.89 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  49.58 
 
 		 358 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  48.78 
 
 		 368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  51.05 
 
 		 416 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  50 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  49.32 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  47.37 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  49.3 
 
 		 354 aa  302  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  44.53 
 
 		 387 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  45.58 
 
 		 409 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  44.68 
 
 		 387 aa  295  7e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  44.41 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  48.69 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  46.68 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  45.78 
 
 		 404 aa  292  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  50 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  50 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  47.2 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  47.87 
 
 		 371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  46.13 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  45.29 
 
 		 382 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  42.89 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  45.14 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  45.53 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  42.59 
 
 		 386 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  44.16 
 
 		 394 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  46.68 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  44.17 
 
 		 371 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  45.65 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  44.12 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  41.85 
 
 		 367 aa  262  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  42.49 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  41.83 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  41.99 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  42.73 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  42.86 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  42.73 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1393  AFG1 family ATPase  42.15 
 
 		 365 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  39.58 
 
 		 376 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  41.24 
 
 		 371 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  41.05 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  41.05 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  41.05 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  41.05 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  41.05 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  41.05 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  42.15 
 
 		 367 aa  256  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1193  AFG1-family ATPase  40.72 
 
 		 365 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.832181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  40.6 
 
 		 371 aa  255  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1487  AFG1 family ATPase  42.15 
 
 		 365 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  41.27 
 
 		 365 aa  255  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  41 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  43.02 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  42.15 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  42.15 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1433  AFG1 family ATPase  42.15 
 
 		 365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0379447  normal  0.0822065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1272  hypothetical protein  41.55 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1100  AFG1-family ATPase  41 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.875706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  42.44 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  41 
 
 		 365 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  40.44 
 
 		 366 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  41.48 
 
 		 365 aa  252  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  41.71 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  37.33 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  40.06 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  38.44 
 
 		 373 aa  250  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  38.94 
 
 		 377 aa  250  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  41.21 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  40.11 
 
 		 374 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  39.78 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  38.01 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  37.6 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  37.33 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  37.83 
 
 		 375 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  38.01 
 
 		 374 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  40.11 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  37.83 
 
 		 375 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  40.11 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  37.83 
 
 		 375 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  40.11 
 
 		 369 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2009  hypothetical protein  43.12 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  39.84 
 
 		 367 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  39.44 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  37.33 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  39.84 
 
 		 367 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  40 
 
 		 393 aa  246  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  38.4 
 
 		 376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  36.71 
 
 		 368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  38.32 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>