More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1279 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1279  CinA-like protein  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  64.24 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  59.62 
 
 		 167 aa  175  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  50.93 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  53.33 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  50.93 
 
 		 165 aa  134  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  53.25 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  50.93 
 
 		 165 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  52.17 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  53.95 
 
 		 167 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  50.97 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  51.95 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  52.6 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  52.63 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  47.31 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  53.9 
 
 		 161 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  46.53 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  48 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  53.29 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  47.33 
 
 		 164 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  49.35 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  49.06 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  51.77 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  49.68 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  47.06 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  51.39 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  46.99 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  52.46 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  49.34 
 
 		 175 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  45.66 
 
 		 168 aa  118  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  46.43 
 
 		 411 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  51.45 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  58.65 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  48.23 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  58.65 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1704  CinA domain protein  44.26 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  50 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  47.59 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  58.65 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  50.69 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  57.69 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  45.45 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  57.69 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  48.98 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  49.67 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  48.98 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  48.98 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0525  CinA domain protein  50 
 
 		 163 aa  115  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  57.69 
 
 		 166 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  48.3 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  45.24 
 
 		 165 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  46.95 
 
 		 166 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  43.84 
 
 		 424 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  48.08 
 
 		 422 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  44.38 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  47.18 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  48.3 
 
 		 165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  37.89 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  45.91 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  54.81 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  47.71 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  47.71 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  51.47 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  47.71 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  48.65 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  47.83 
 
 		 432 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  41.55 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1911  CinA domain-containing protein  58.47 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.162967  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  55.77 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  48.23 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  41.4 
 
 		 424 aa  111  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  46.67 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  47.1 
 
 		 168 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  54.81 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  51.49 
 
 		 426 aa  111  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  49.65 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  51.39 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  46.71 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  45.14 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  43.17 
 
 		 403 aa  110  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0633  putative competence-damaged protein  40.37 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  55.77 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  48.25 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  50.72 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  44.03 
 
 		 412 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  54.87 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  39.49 
 
 		 424 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  48.2 
 
 		 162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  45.57 
 
 		 160 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  48.39 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  42.68 
 
 		 163 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>